Las nebulosas planetarias y regiones H II tienen espectros con líneas de emisión producidas por distintos iones. Las intensidades relativas de estas líneas pueden utilizarse para estimar las condiciones físicas (densidad y temperatura electrónica) y la composici ón química del gas ionizado, lo cual nos da información sobre procesos relacionados con la evolución estelar y la evolución química de las galaxias. Sin embargo, estas determinaciones tienen asociados incertidumbres que dificultan la interpretación de los resultados. Las incertidumbres se deben tanto a errores observacionales como a errores introducidos por la metodología de análisis y una de las fuentes de incertidumbres cuyo efecto es más difícil de estimar son los datos atómicos. Existen distintas determinaciones de datos atómicos para cada ion, pero no es fácil decidir cuál es la mejor. Las distintas determinaciones pueden utilizarse para explorar cuánta incertidumbre están introduciendo los datos atómicos en nuestros cálculos. En este trabajo exploramos el efecto que tiene usar distintos datos atómicos (y todas las combinaciones posibles entre ellos) en la determinación de condiciones físicas y abundancias químicas en nebulosas planetarias y regiones H II. Los resultados muestran que el efecto de los datos atómicos no deben ser despreciado ya que introducen variaciones de hasta 0.6 dex en las densidades, 20% en temperatura y hasta 0.7 dex en las abundancias de O/H. Para los objetos de la muestra se determinó la probabilidad de que las densidades calculadas con los cuatro diagnósticos ([O II], [S II], [Cl III] y [Ar IV]) sean compatibles con que exista una única densidad en toda la nebulosa. También se estudiaron los cociente teóricos de líneas de [O III], [N II] y [S III] que se producen en el mismo nivel superior comparándolos con resultados observacionales. Utilizando análisis bayesiano, esta comparación nos permite asignar distintos pesos o probabilidades a los distintos conjuntos de probabilidades de transición disponibles para estos iones. Los resultados obtenidos nos permitirán establecer criterios para realizar un análisis bayesiano de la composición química en nebulosas ionizadas, que tome en cuenta todas las posibles fuentes de incertidumbre.