dc.contributor | DELFEENA EAPEN | |
dc.creator | JESUS JONATHAN MARTINEZ GUADARRAMA | |
dc.date | 2019-05-28 | |
dc.date.accessioned | 2023-07-25T12:48:33Z | |
dc.date.available | 2023-07-25T12:48:33Z | |
dc.identifier | http://riaa.uaem.mx/handle/20.500.12055/750 | |
dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/7792882 | |
dc.description | Resumen
Las plantas tienen la capacidad de dirigir el crecimiento de sus raíces hacia fuentes de humedad, este fenómeno es conocido como hidrotropismo y puede ser utilizado como mecanismo de evasión a la sequía, sin embargo este fenómeno es poco estudiado y a pesar de su potencial aplicación se conoce muy poco en plantas de interés agrícola como el maíz.
El objetivo de este trabajo fue identificar genes relacionados a la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz a través de análisis de asociación del genoma completo (Genome-Wide Association Studies, GWAS) en una población de 231 híbridos de maíz DTMA (Drought Tolerant Maize for Africa). El análisis tipo GWAS partió de la fenotipificación de la respuesta hidrotrópica y la identificación de SNPs en la población de híbridos DTMA. A partir de estos datos obtenidos se realizó el análisis tipo GWAS, en el cual se identificaron más de 23 mil SNPs asociados a la respuesta hidrotrópica de maíz. Se realizó la búsqueda de información de los 100 SNPs con la mayor asociación (valor P) a dicha respuesta y fueron seleccionados los genes NRT1.1, EGY3, NPH3 y DUF1005 para explorar sus funciones reportadas y posible participación en la vía de señalización de la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz. A través de PCR tiempo final se identificó que DUF1005 se expresa a 6 horas de exposición a un gradiente de humedad in vitro, y de forma diferencial en híbridos con y sin respuesta hidrotrópica. Interesantemente, el SNP con mayor asociación a la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz se situó dentro del gen DUF1005. | |
dc.format | pdf | |
dc.language | spa | |
dc.publisher | El autor | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 | |
dc.subject | info:eu-repo/classification/cti/7 | |
dc.subject | info:eu-repo/classification/cti/33 | |
dc.title | Identificación de genes relacionados a la respuesta hidrotrópica en maíz mediante estudios de asociación del genoma completo (genome-wide association studies, gwas) | |
dc.type | info:eu-repo/semantics/masterThesis | |
dc.coverage | MEX | |
dc.audience | researchers | |