The aim of this study was to determine the clinical and epidemiological characteristics of the confirmed cases of Zika and dengue, presented during the El Niño Costero phenomenon, period January-June 2017 and that were treated at the Health Centre of the Pueblo Nuevo district, province of Chincha, in Ica, Peru. An observational, descriptive and retrospective study was designed that systematized demographic information, clinical signs and the time elapsed between the beginning of these and the investigation, notification and confirmation of the cases. In total, 130 confirmed positive cases for Zika and 44 for dengue were recovered. The greatest number of cases were reported between epidemiological weeks 12 and 15 and in women (76.9% of Zika and 63.6% of dengue). The greatest number of Zika and dengue cases occurred in the age group of 20-29 years (30.0 and 27%, respectively). The most frequent clinical signs in both cases were exanthema, headache, myalgia, ocular/retrocular pain and arthralgia/polyarthralgia. The relationship between the temporal behaviour of the cases and the interventions carried out show that the nebulization application had a greater effect, reducing the number of confirmed cases after the application. It is concluded that early recognition and notification of the presence of dengue and zika, as well as the use of nebulization for vector control have a direct impact on the number of new cases of these diseases in a non-endemic area.El objetivo del estudio fue determinar las características clínicas y epidemiológicas de los casos confirmados de zika y dengue, presentados durante el Fenómeno de El Niño Costero, periodo enero-junio de 2017 y que fueran atendidos en el Centro de Salud del distrito Pueblo Nuevo, provincia de Chincha, Ica, Perú. Se diseñó un estudio observacional, descriptivo y retrospectivo que sistematizó información demográfica, signos clínicos y tiempo transcurrido entre el inicio de estos y la investigación, notificación y confirmación de los casos. Se recuperaron 130 casos confirmados positivos a zika y 44 a dengue. La mayor cantidad de casos se reportaron entre las semanas epidemiológicas 12 y 15 y en mujeres (76.9% de zika y 63.6% de dengue). La mayor cantidad de casos de zika y dengue se presentó en el grupo etario de 20-29 años (30.0 y 27.3%, respectivamente). Los signos clínicos más frecuentes en ambos casos fueron exantema, cefalea, mialgias, dolor ocular/retrocular y artralgia/poliartralgia. La relación entre el comportamiento temporal de los casos y las intervenciones realizadas muestran que la aplicación de la nebulización tuvo un mayor efecto, disminuyendo la cantidad de casos confirmados después de la aplicación. Se concluye que un reconocimiento y notificación temprana de la presencia de dengue y zika, así como el uso de las nebulizaciones para control del vector, tienen un impacto directo sobre la cantidad de nuevos casos de estas enfermedades en una zona no endémica.