[Introduction]: The evaluation of ecosystem services in different land-use systems in family farming facilitates the development of sustainable land-use strategies. [Objective]: To study the effects of different land uses, commonly applied in family farming in the Mbaracayu Forest Biosphere Reserve (Canindeyú, Paraguay), on the conservation of tree diversity and delivery of critical ecosystem services: above- and belowground carbon storage and supporting services rendered by soil. [Methods]: We determined the diversity of trees, the aboveground carbon and soil stocks, and chemical and physical soil properties in 7 farms with diverse land-use systems: disturbed native forest, agroforestry system with yerba mate, subsistence crops and pastures. In each sampling point, data of the tree and shrub individuals were recorded, and samples of the herbaceous stratum, litter, and soil were taken. [Results]: We found the highest rate of both diversity and above-ground carbon storage in the disturber native forests and agroforestry systems without significant differences between the two. The values of CEC and Ca+2 in the soil were higher in disturbed native forests compared to pastures, while the remaining land uses showed intermediate values. There were no significant differences between the different land-use types regarding carbon storage and the physical stability of the soils. Nonetheless, the pastures had the lowest soil qualities. [Conclusions]: We demonstrated that the altered native forests and agroforest systems with yerba mate promote better the conservation of tree diversity, carbon retention, and soil quality.[Introducción]: La evaluación del suministro de servicios ecosistémicos por los diferentes usos del suelo de la agricultura familiar facilita plantear estrategias para el uso sostenible de la tierra. [Objetivo]: Se determinaron los efectos de diferentes usos del suelo practicados en la agricultura familiar, sobre la conservación de la diversidad arbórea y el suministro de servicios ecosistémicos críticos: almacenamiento de carbono aéreo y subterráneo y servicios de soporte que provienen del suelo, en la Reserva de Biosfera del Bosque Mbaracayú (Canindeyú, Paraguay). [Metodología]: Fue determinada la biodiversidad arbórea, el almacenamiento de carbono aéreo y de suelo, las propiedades químicas y físicas del suelo en 7 fincas con diversos tipos de cobertura: bosque nativo alterado, sistemas agroforestales con yerba mate, cultivo anual de subsistencia y pasturas. En cada uno de los puntos de muestreo, fueron registrados datos de los individuos arbóreos y arbustivos, y fueron tomadas muestras del estrato herbáceo, hojarasca y suelo. [Resultados]: Se registró mayor índice de diversidad y almacenamiento de carbono aéreo en bosques nativos alterados y sistemas agroforestales, sin diferencia significativa entre ellos. Los valores de CIC y Ca+2 de suelo fueron más elevados en los bosques nativos alterados comparado con pasturas, y los otros usos presentaron valores intermedios. No hubo diferencias significativas entre los diferentes usos en cuanto al carbono almacenado ni en estabilidad de la estructura del suelo. Sin embargo, las pasturas presentaron índices de calidad de suelo más bajos. [Conclusiones]: Se demostró que bosques nativos alterados y sistemas agroforestales aportan más a la conservación de la diversidad arbórea, retención de carbono y calidad del suelo.[Introdução]: A avaliação do fornecimento de serviços ecossistêmicos pelas diferentes utilizações do solo da agricultura familiar facilita a definição de estratégias para uma utilização sustentável do solo. [Objetivo]: Foram determinados os efeitos de diferentes usos do solo praticados na agricultura familiar, na conservação da diversidade arbórea e no fornecimento de serviços ecossistêmicos críticos: armazenamento de carbono aéreo e subterrâneo e serviços de apoio provenientes do solo, na reserva da Biosfera da Floresta Mbaracayú (Canindeyú, Paraguai). [Metodologia]: Foi determinada a biodiversidade arbórea, o armazenamento de carbono aéreo e de solo, as propriedades químicas e físicas do solo em 7 sítios com vários tipos de cobertura: floresta nativa alterada, sistemas agroflorestais com mate, cultivo de subsistência anual e pastagem. Em cada um dos pontos de amostragem, foram registrados dados de indivíduos arbóreos e arbustivos, e foram colhidas amostras de estrato herbáceo, folhas e solo. [Resultados]: Maior índice de diversidade e armazenamento de carbono aéreo foi registado em florestas nativas alteradas e sistemas agroflorestais, sem diferença significativa entre elas. Os valores de CIC e Ca+2 de solo foram mais elevados nas florestas nativas alteradas quando comparados a pastagens, e os demais usos apresentaram valores intermediários. Não houve diferenças significativas entre as utilizações em relação ao carbono armazenado ou em relação à estabilidade da estrutura do solo. No entanto, as pastagens apresentaram menores índices de qualidade do solo.  [Conclusões]: As florestas nativas alteradas e os sistemas agroflorestais mostraram-se mais importantes para a conservação da diversidade arbórea, retenção de carbono e qualidade do solo.