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Detection of the Omicron variant of SARS- CoV-2 by restriction analysis targeting the mutations K417N and N440K of the spike protein.: Detección de la Variante Ómicron del SARS-CoV-2 por análisis de restricción de dos mutaciones de la proteína de la espiga.
Autor
Jaspe, Rossana C.
Zambrano, José Luis
Hidalgo, Mariana
Sulbarán, Yoneira
Loureiro, Carmen L.
Moros, Zoila C.
Garzaro, Domingo J.
Liprandi, Ferdinando
Rangel, Héctor R.
Pujol, Flor H.
Institución
Resumen
By the end of 2021, the Omicron variant of concern (VOC) emerges in South Africa. This variant caused immediate concern, due to the explosive increase in cases associated with it and the large number of mutations it exhibits. In this study, the restriction sites that allow detecting the mutations K417N and N440K in the Spike gene are described. This analysis allows us to propose a rapid method for the identification of cases infected with the Omicron variant. We show that the proposed methodology can contribute to provide more information on the prevalence and rapid detection of cases of this new VOC. Para finales de 2021 surge la variante de preocupación (VOC por sus siglas en inglés) Ómicron en Sudáfrica. Esta variante causó de forma inmediata preocupación, debido al aumento explosivo de casos asociados a ella y al gran número de mutaciones que exhibe. En este estudio, se describen lossitios de restricción que permiten detectar dos de estas mutaciones en el gen de la espiga, las mutaciones K417N y N440K. Este análisis permite proponer un método rápido para la identificación de casos infectados con la variante Ómicron. Mostramos que la metodología propuesta puede contribuir a proporcionar más información sobre la prevalencia y a detectar rápidamente los casosde esta nueva VOC.