Un método simple para la detección de mutaciones en el aminoácido 452 de la proteína de la Espiga del SARS-CoV-2, usando análisis de enzimas de restricción.: A simple method for detection of mutations in amino acid 452 of the Spike protein of SARS-CoV-2 using restriction enzyme analysis.

A simple method for detection of mutations in amino acid 452 of the Spike protein of SARS-CoV-2 using restriction enzyme analysis.: Un método simple para la detección de mutaciones en el aminoácido 452 de la proteína de la Espiga del SARS-CoV-2, usando análisis de enzimas de restricción.

dc.creatorJaspe, Rossana C.
dc.creatorSulbaran, Yoneira
dc.creatorHidalgo, Mariana
dc.creatorLoureiro, Carmen L.
dc.creatorMoros, Zoila C.
dc.creatorGarzaro, Domingo J.
dc.creatorRangel, Héctor R.
dc.creatorPujol, Flor H.
dc.date2021-11-29
dc.date.accessioned2022-11-05T01:03:31Z
dc.date.available2022-11-05T01:03:31Z
dc.identifierhttps://produccioncientificaluz.org/index.php/investigacion/article/view/37282
dc.identifier10.22209/IC.v62n4a07
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/5136264
dc.descriptionVariants of Concern or Interest of SARS-CoV-2 (VOC or VOI), the coronavirus responsible for COVID-19, have emerged in several countries. Mutations in the amino acid 452 of the Spike protein are particularly important and associated with some of these variants: L452R, present in Delta VOC, and L452Q, present in Lambda VOI. These mutations have been associated with both increased infectivity and evasion of protective immune response. A search on GISAID to detect the number of sequences harboring the L452R mutation and the frequency of Delta VOC among them, showed that since August 2021, most of these sequences belong to the Delta VOC. Restriction enzyme analysis is proposed as a rapid method to detect L452R. A small amplicon from the Spike gene was digested with MspI. A 100% concordance was observed between digestion and sequencing results. The mutation L452Q can also be detected by restriction analysis, allowing the identification of putative Lambda VOIs. The proposed methodology, which allows screening of a great number of samples, could provide a faster information on the prevalence of Delta VOC cases.en-US
dc.descriptionLas variantes de preocupación o interés del SARS-CoV-2 (VOC o VOI, por sus siglas en inglés), el coronavirus responsable de la COVID-19, han surgido en varios países. Las mutaciones en el aminoácido 452 de la proteína de la Espiga son particularmente importantes y están asociadas con algunas de estas variantes: L452R, presente en la VOC Delta, y L452Q, presente en la VOI Lambda. Estas mutaciones se han asociado con un aumento de la infectividad y la evasión de respuesta inmunitaria protectora. Una búsqueda en GISAID para detectar el número de secuencias que albergan la mutación L452R y la frecuencia de la VOC Delta entre ellas, mostró que desde agosto de 2021, la mayoría de estas secuencias pertenecen a la VOC Delta. Se propone el análisis de enzimas de restricción como un método rápido para detectar L452R. Se digirió un pequeño amplicón de un fragmento del gen de la espiga con MspI. Se observó una concordancia del 100% entre la identificación de la mutación a través de la digestión y los resultados de la secuenciación. La mutación L452Q también se puede detectar mediante análisis de restricción, lo que permite la identificación de posibles VOI Lambda. La metodología propuesta, que permite el cribado de un gran número de muestras, podría contribuir a proporcionar más información sobre la prevalencia y a detectar rápidamente los casos de la VOC Delta.es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.formattext/html
dc.languageeng
dc.publisherUniversidad del Zuliaes-ES
dc.relationhttps://produccioncientificaluz.org/index.php/investigacion/article/view/37282/40664
dc.relationhttps://produccioncientificaluz.org/index.php/investigacion/article/view/37282/40665
dc.sourceInvestigación Clínica; Vol. 62 Núm. 4 (2021): Investigación Clínica; 371-377es-ES
dc.source2477-9393
dc.source0535-5133
dc.subjectCOVID-19en-US
dc.subjectSARS-CoV-2en-US
dc.subjectDelta Variant of Concernen-US
dc.subjectRFLPen-US
dc.subjectrapid screeningen-US
dc.subjectmutation L452Ren-US
dc.subjectCOVID-19es-ES
dc.subjectSARS-CoV-2es-ES
dc.subjectDelta Variant of Concernes-ES
dc.subjectRFLPes-ES
dc.subjectdetección rápidaes-ES
dc.subjectmutación L452Res-ES
dc.titleUn método simple para la detección de mutaciones en el aminoácido 452 de la proteína de la Espiga del SARS-CoV-2, usando análisis de enzimas de restricción.: A simple method for detection of mutations in amino acid 452 of the Spike protein of SARS-CoV-2 using restriction enzyme analysis.en-US
dc.titleA simple method for detection of mutations in amino acid 452 of the Spike protein of SARS-CoV-2 using restriction enzyme analysis.: Un método simple para la detección de mutaciones en el aminoácido 452 de la proteína de la Espiga del SARS-CoV-2, usando análisis de enzimas de restricción.es-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion


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