Thesis
Estudio de herencia de la resistencia en arroz al hongo rhizoctonia solani y su asociación con marcadores moleculares microsatélites
Study on inheritance of resistance to rice rhizoctonia solani and its association with microsatellite molecular markers
Autor
Cardona Ascanio, Reinaldo
Institución
Resumen
Con el fin de investigar la herencia de la resistencia en el arroz a Rhizoctonia solani, (causante de la pudrición de la vaina en arroz, PDV) y su asociación con microsatélites marcadores moleculares se hicieron un par de cruces entre los padres de arroz resistentes (Palmar y Jeferson) y susceptibles (Fonaiap1 y Fonaiap2000) para obtener dos poblaciones experimentales para evaluar la herencia de la resistencia a R. solani y determinar la asociación con microsatélites que mostraron polimorfismos entre los padres evaluados. La progenie F2 de Palmar por Fonaiap1 y Jefferson por Fonaiap2000, en el comienzo de la emergencia de la panícula, se inocularon 4 hojas en el nudo dentro de la vaina con micelio del hongo cultivado en agar y se colocaron las plantas en una cámara de humedad durante una semana. Después de este tiempo se midió el área afectada por la enfermedad de PDV en cada planta y se agruparon de acuerdo a la escala de evaluación. De la progenie y sus descendientes se tomaron muestras de hojas para la extracción de ADN para evaluar los marcadores moleculares microsatélites seleccionados de la página web Graminae y se amplificó con la ayuda de un termociclador, los productos amplificados se colocaron individualmente en los pocillos de un gel de agarosa al 3% y se llevó a cabo la electroforesis en la cámara para esto.P ara la detección de QTLs que confieren resistencia a PDV, se utilizó el método de mapeo por intervalos compuestos usando el descargas de Windows QTL Cartógrapher 2,5 decretando la presencia de QTL con umbral LOD> 2,4 (P = 0,05). No se detectaron QTL en la progenie de cruces entre Jefferson X F2000, mientras que la progenie de los cruces Pamar X Fonaiap1 se detectaron 3 QTLs localizados en los cromosomas 1, 4 y 12, flanqueado por los marcadores RM 572 y RM449, RM273 y RM3471, RM3472 y RM309, respectivamente. Los QTLs detectado en este trabajo son una valiosa contribución al estudio de la resistencia en el arroz a R. solani In order to investigate the inheritance of resistance in rice to Rhizoctonia solani (causing sheath blight in rice, ShB) and its association with microsatellite molecular markers were made a couple of crosses between rice parents resistant (Palmar and Jeferson) and susceptible (Fonaiap 1 and Fonaiap 2000) so obtain two experimental populations for assess the inheritance of resistance to R. solani and determine the association with microsattelite that showed polymorphisms between the parents evaluated. The F2 progeny from Palmar X Fonaiap1 and Jefferson X Fonaiap2000, at the beginning of the panicle emergence, were inoculated 4 leaves at the knot within the sheath with fungus mycelium grown in agar and were placed the plants in moist chamber for a week. After this time was measured the affected area by disease PDV at each plant and were grouped according to the assessment scale. From the progeny and their descendants leaf samples were taken for DNA extraction to evaluate the molecular markers microsatellite selected from Graminae web page and was amplified with the aid of a thermal cycler, the amplified products were individually placed in wells of an agarose gel 3% and was carried out the electrophoretic run in the camera for this. For detection of QTLs conferring resistance to ShB, were used method of composite interval mapping using the sofware Windows QTL Cartographer 2.5 decreeing the presence of QTL with LOD threshold> 2.4 (P = 0.05). Were not detected QTLs in the progeny from crosses between Jefferson X F2000 while the progeny from crosses Palmar X F1 were detected 3 QTL located on chromosomes 1, 4 and 12, flanked by markers RM 572 and RM449, RM273 and RM3471, RM309 and RM3472, respectively. The QTLs detected in this work are a valuable contribution to the study of resistance to R. solani