El Virus de Papiloma Humano (VPH) pertenece a la familia Papillomaviridae. El genoma viral está compuesto por una molécula circular de ácido desoxirribonucleico (ADN) de doble cadena, que contiene aproximadamente 7.900 pb. Hasta el momento se han logrado identificar más de doscientos tipos virales, clasificados de la siguiente forma: bajo riesgo oncogénico, como los tipos 6, 11, 32, 42 y 43 y alto riesgo oncogénico, que incluye los tipos 16, 18, 31, 33, 34, 35, 39, 45, 56, 59, 66, 68 y 70. Los productos proteicos de los genes E6 y E7 de los tipos de VPH de alto riesgo, son capaces de inactivar las proteínas p53 y pRb, desencadenando un proceso que conlleva a la progresión de las lesiones a cáncer cérvicouterino. La infección por VPH es considerada actualmente como la enfermedad de transmisión sexual más frecuente en el mundo y como el principal factor etiológico de lesiones intraepiteliales y de cáncer cervicouterino. En Venezuela, cada año 4.116 mujeres son diagnosticadas con cáncer cervical y 1853 mueren a causa del cáncer cérvicouterino, según la Organización Mundial para la Salud. Por este motivo y debido al reciente desarrollo de las vacunas preventivas contra el VPH es de gran importancia el estudio y la comparación de técnicas de biología molecular que permitan el diagnóstico y tipificación de los diferentes tipos virales en la población. En tal sentido, en el presente trabajo se evaluaron muestras citológicas, tomadas en el área genital, de 80 mujeres jóvenes con diagnóstico clínico sugestivo de infección por VPH y 20 con diagnóstico clínico normal, como pacientes control; con edades promedio de 24,78 ± 5,27 y 21,30 ± 3,96, respectivamente, que acudieron a la consulta de ginecología de la Organización de Bienestar Estudiantil de la Universidad Central de Venezuela (OBE-UCV). La detección y tipificación del VPH se llevó a cabo mediante RCP múltiple con el estuche comercial Seeplex® HPV4A ACE Sreening de Seegene Inc., y el método de Captura de Híbridos 2 (Digene). Las muestras positivas para VPH fueron: 52,5% con la RCP Seeplex® y 58,75% con la CH2. Los controles positivos para VPH correspondieron a: un 55% con RCP Seeplex® y 60% con CH2. El tipo de VPH, más común, encontrado en las muestras y controles fue el de alto riesgo oncogénico. Se encontró un 68,75% de correlación entre los resultados positivos y negativos de RCP Seeplex® y CH2 en las muestras y un 75% en los controles, con asociación entre estos resultados (p<0,05) y grado de acuerdo moderado k. En cuanto a la tipificación, se obtuvo un 51,25% de coincidencia en las muestras y un 70% en los controles, con asociación entre los resultados (p<0,05) y grado de acuerdo moderado k. El método CH2 presentó mayor sensibilidad que la RCP Seeplex® (80% y 79,2%, respectivamente) y la especificidad de la RCP Seeplex® fue menor que la de CH2 (19,2% y 20% respectivamente). No se encontró asociación entre las variables: RCP/DC, CH2/DC, Factores de riesgo/VPH+ y Carga viral/DC. En conclusión, se encontró relación entre los métodos estudiados y las pacientes presentaron un alto porcentaje de infección por VPH de alto riesgo, diferente a los tipos más comunes (16 y 18) incluidos en las vacunas. Se sugiere que las pacientes control positivas, se encuentran en una fase latente de la infección viral, por presentar diagnóstico clínico normal y estar infectadas (en su mayoría), por VPH de alto riesgo oncogénico.