Bothrops colombiensis es una de las serpientes responsable del 85 % de los accidentes ofídicos reportados anualmente. Induce un cuadro clínico caracterizado por edema, necrosis, coagulopatias y hemorragias locales y sistémicas, sin embargo las alteraciones sistémicas desarrolladas por este veneno no han sido puntualmente evaluadas, por lo que se planteó caracterizar el veneno total de Bothrops colombiensis y sus fracciones obtenidas por exclusión molecular, por la evaluación de: 1) sus actividades letal, edematizante, coagulante, desfibrinante, hemorrágica, necrosante y fosfolipasa A2 (PLA2), 2) su compromiso fisiopatológico sobre órganos vitales en ratones y 3) la alteración de los marcadores séricos CPK, AST, ALT, BUN, creatinina, glicemia y amilasa. Para la caracterización toxinológica se emplearon los métodos in vivo recomendados por la OMS, utilizando ratones blancos. En la determinación de las actividades coagulante y PLA2 se emplearon los métodos de Furukawa (1977) y de De Hass modificado por Yang and King (1980), respectivamente. Los efectos fisiopatológicos en riñón, hígado, corazón, pulmón, páncreas y músculo esquelético y las variaciones de los marcadores de lesión tisular en ratones tratados con dosis única del veneno y las fracciones, se evaluaron en muestras recolectadas a diferentes lapsos post-tratamiento por vía IM, empleando técnicas de microscopía de luz y espectrofotométricas. Los resultados obtenidos, mostraron que el veneno indujo un perfil toxinológico similar al de otras especies botrópicas. Se obtuvieron tres fracciones viables FI, FII y FIII, todas indujeron actividad hemorrágica y edematizante, la FI y la FII mostraron actividad desfibrinante, coagulante y un severo cuadro neurotóxico, nunca antes descrito con ésta especie y sólo la FIII presentó actividad PLA2. Los estudios histopatológicos mostraron que el veneno desarrolló lesiones en músculo esquelético, corazón y riñón, con incrementos de AST, ALT, CPK, BUN y amilasa. La FI y la FII indujeron lesiones en músculo esquelético, corazón y páncreas, con incrementos de CPK, AST, ALT y BUN, en cuanto a los marcadores pancreáticos la FI incrementó la amilasa y la FII la glicemia. La FIII indujo lesiones en corazón y páncreas de acuerdo a la histopatología e incrementos de CPK, AST, ALT, creatinina, BUN y amilasa. Evidenciando una serie de alteraciones fisiopatológicas en diversos órganos vitales, que reflejan el compromiso sistémico de los constituyentes presentes en el veneno evaluado y sugieren la necesidad de una oportuna y efectiva intervención médica.