tesis de maestría
Asociación de los SNPs en genes relacionados al metabolismo de la vitamina D y de los niveles plasmáticos de 25-hidroxivitamina D, con el riesgo de diabetes tipo 2, en población urbana costarricense
Fecha
2020-05-08Autor
Monge Rodríguez, Silvia Leticia
Institución
Resumen
Objetivo: Analizar la relación entre los niveles plasmáticos de 25-hidroxivitamina D y los polimorfismos de genes relacionados con el metabolismo de la vitamina D, con la diabetes tipo 2 (DM2), en una muestra de adultos habitantes de Desamparados, Costa Rica.
Metodología: Este fue un estudio observacional caso – control realizado en la Universidad de Costa Rica (UCR) que incluyó a 578 personas, de las cuales 316 fueron DM2 y 262 no diabéticas (130 con estado glicémico normal y 132 con prediabetes). Este estudio recibió aprobación del Comité Ético Científico de la UCR. Todos los participantes debían tener al menos dos parientes de dos generaciones previas nacidos en el Valle Central de Costa Rica. Se realizó un análisis de asociación por medio de modelos de regresión en los cuales se estudió la relación de 25-hidroxivitamina D plasmático con la DM2, y de este metabolito con 9 SNPs ubicados en genes relacionados con el metabolismo de vitamina D. También se analizó la relación entre los 9 SNPs con la DM2. En los modelos se incluyeron las variables: sexo, edad, IMC, perfil de lípidos, HTA y ancestría.
La cuantificación de la 25-hidroxivitamina D plasmática se realizó por medio de electroquimioluminiscencia en el equipo ARCHITECT. La genotipificación de los SNPs rs4588 y rs7041 del gen GC por medio de PCR en Tiempo Real con sondas TaqMan. El análisis estadístico se realizó con los programas PLINK 1.9 y IBM SPSS 22.
Resultados: La mayoría de las personas presentaron niveles plasmáticos de 25-hidroxivitamina D en rangos de deficiencia o insuficiencia. Los niveles plasmáticos promedio de 25-hidroxivitamina fueron menores en las personas con DM2 (23,22 ± 8,05 ng/mL) que en aquellas sin DM2 (25,98 ± 7,51 ng/mL) (p<0,0001). La 25-hidroxivitamina D plasmática podría asociarse con el riesgo de DM2 (p= 0,058). El rs4588 y rs3755967 del gen GC se asociaron en forma negativa con los niveles plasmáticos de 25-hidroxivitamina D. No hubo asociación entre los 9 SNPs y el riesgo de DM2.
Conclusión: Los niveles bajos de 25-hidroxivitamina D plasmática se asocian con un mayor IMC y podrían aumentar el riesgo de DM2 en la población estudiada, sin embargo, su efecto es menor que el de factores de riesgo clásicos como la HTA, el sobrepeso y la obesidad. Los SNPs asociados modifican la interacción de la proteína GC con la 25-hidroxivitamina D, y de esta forma alteran la concentración total de este metabolito en plasma. Objective: To analyze the relationship between plasma levels of 25-hydroxyvitamin D and gene polymorphisms related to vitamin D metabolism, with type 2 diabetes (DM2), in a sample of adults living in Desamparados, Costa Rica.
Methodology: This work was an observational case - control study conducted at the University of Costa Rica (UCR). There were 578 people included, of which 316 were DM2 and 262 non-diabetic (130 with normal glycemic status and 132 with prediabetes). The study was approved by the Scientific Ethical Committee of the UCR. All participants must have at least two relatives from two previous generations born in the Central Valley of Costa Rica. The association analysis of plasmatic 25-hydroxyvitamin D with DM2 was performing with a regression model. Also, it was studied the relationship between this metabolite with 9 SNPs located in genes related to vitamin D metabolism, and these 9 SNPs with DM2. The models were adjusted by variables of sex, age, BMI, lipid profile, arterial hipertension and ancestry.
The quantification of plasma 25-hydroxyvitamin D was done with electrochemiluminescence in the ARCHITECT equipment. Genotyping of the rs4588 and rs7041 SNPs of the GC gene was carried out by Real-Time PCR with the use of TaqMan probes. Statistical analysis was performed with PLINK 1.9 and IBM SPSS 22 programs.
Results: It was found that most people presented plasma levels of 25-hydroxyvitamin D in deficiency or insufficiency ranges. The average plasma levels of 25-hydroxyvitamin was lower in people with DM2 (23,22 ± 8,05 ng/mL) than in those without DM2 (25,98 ± 7,51 ng/mL) (p<0,0001).. Plasma 25-hydroxyvitamin D could be associated with the risk of DM2 (p= 0,058). The rs4588 and rs3755967 of the GC gene were associated negatively with plasma levels of 25-hydroxyvitamin D. There was no association between the SNPs included in this study and the risk of DM2.
Conclusion: Low plasma 25-hydroxyvitamin D is associated with higher BMI and it could increase risk of DM2 in the studied population, however, its effect in the development of DM2 is lower than arterial hypertension, dyslipidemia or overweight. The associated SNPs modify the interaction of the GC protein with the 25-hydroxyvitamin D, and thus alter the total concentration of this metabolite in plasma.