Marcadores moleculares de ADN y su aplicación en el análisis de la estructura genética de poblaciones de choro zapato (Choromytilus chorus) (Molina 1782) (Bivaalvia: Mytilidae)
Autor
Rodríguez Vásquez, Sofía Alejandra
Institución
Resumen
El choro zapato (Choromytilus chorus) es una especie apreciada en nuestro país y un recurso altamente atractivo para la producción. Sin embargo, la sobreexplotación del recurso ha llevado a la disminución de bancos naturales en el país. Con el objeto de conocer como los factores genéticos contribuyen a la formación de stocks para así poder planificar la explotación de este recurso, evitar la pérdida de características poblacionales importantes y permitir la conservación de su patrimonio genético, se procedió a la búsqueda de marcadores moleculares de ADN para la diferenciación intraespecífica de poblaciones naturales de choro zapato en las costas de Chile. En el presente trabajo se estudiaron genes nucleares y mitocondriales de 198 individuos provenientes de 4 localidades de Chile: Iquique, Bahía de Concepción, seno del Reloncaví y Puerto Edén. Mediante PCR se lograron amplificar genes mitocondriales COIII, D-loop, el gen ribosomal nuclear ITS y secuenciar COIII e ITS. Se ensayó la restricción del fragmento ITS con 10 endonucleasas (PCR-RFLP) y solo una enzima (Dde I) permitió detectar polimorfismo en este gen, marcador que fue utilizado en el análisis de la estructura genética de la población. El análisis estadístico no arroja suficiente evidencia para identificar la presencia de stocks discretos ( FST=0.02 ), probablemente debido a un gran flujo génico (Nm=11.2). Sin embargo, se observó un menor número de heterocigotos en la localidad de Iquique con respecto a las localidades del sur que sugiere la posibilidad de una incipiente diferenciación que debe ser comprobada con nuevos muestreos y marcadores moleculares de mayor resolución. Los resultados establecen un marcador molecular para el monitoreo del patrimonio genético en ésta especie, sin embargo es necesario confirmar y apoyar estos resultados con un mayor número de marcadores moleculares. The choro zapato or “shoe mussel”, (Choromytilus chorus) is a native and very appreciated specie in Chile because of its nutritive features and great size that it can reach (30 cm). This distinguishes this mussel from other mussels and converts it in a very attractive natural resource for production. However the overexploitation has led to the reduction of natural beds. To know the manner in which genetic factors contribute to the creation of stocks, avoid the lost of important population features and allow the conservation of its genetic patrimony, the procedure of this study was to search for DNA molecular markers to perform intraspecific differentiation of natural populations of C. chorus. In this study nuclear and mitochondrial genes of 198 individuals were analyzed from 4 different localities in Chile: Iquique, bahía de Concepción, seno del Reloncaví and Puerto Edén. The COIII and D-loop mitochondrial genes and the ITS nuclear ribosomal gene were PCR amplified and COIII and ITS then sequenced. The restriction enzyme analysis of ITS (PCR-RFLP) with 10 enzymes allowed the detection of polymorphism in this gene only with Dde I. This marker was then used to analyze the genetic structure of the population. The results do not support enough evidence to identify the presence of discrete stocks (FST=0.02), probably due to a great gene flow (Nm=11.2). However in Iquique a fewer number of heterozygotes was observed compared to the southern localities that suggests the possibility of an incipient differentiation, but this has to be proved by additional sampling and application of high resolution molecular markers. These results have established a DNA molecular marker that allows further monitoring of the populations genetic patrimony, however it’s necessary to confirm and support these results further with a greater number of molecular markers.