Estudio de diferentes conformaciones para fragmentos simples del ADN, desoxirribosa y nucleósidos, por métodos de mecánica molecular

Abstract

"El estudio de la estructura del ácido desoxirribonucleico (ADN), de los nucleótidos, nucleósidos y de los ácidos nucléicos (AN) tiene una gran importancia biológica. Los nucleótidos tienen muchas funciones en organismos vivos y para entender su función biológica debemos conocer sus características estructurales. A partir de la estructura de los nucleótidos llegamos a la hélice doble del ADN, la cual forma parte de un principio estructural que cambió el mundo de la bioquímica, y de la doble hélice pasamos a los cromosomas, los cuales contienen la mayor parte de la información genética de un ser vivo. En el presente trabajo se hará un análisis estructural de subunidades de hélice doble del ADN, en particular de nucleósidos y desoxirribosa. Se usarán diferentes campos de fuerzas implementados en el software AMBER (Assisted Model Building with Energy Refinement) para realizar la optimización geométrica de estas estructuras, destacando los campos de fuerzas FF99, BSC1 y OL15, utilizando el método de Mecánica Molecular. Con base en los resultados, se determinará la viabilidad de cada campo de fuerzas usado para reproducir las características estructurales de los fragmentos analizados".