Describing the intestinal microbiota of Holstein Fasciola-positive and -negative cattle from a hyperendemic area of fascioliasis in central Colombia

Abstract

La capacidad de identificar cambios en la composición de la microbiota intestinal de huéspedes parasitados es importante para comprender los procesos fisiológicos que pueden afectar la productividad animal. Dentro del campo de las interacciones huésped-parásito, muchos estudios han sugerido que los helmintos pueden influir en la composición microbiana de sus huéspedes a través de sus efectos inmunomoduladores. La fascioliasis bovina es una helmintiasis ampliamente estudiada por los inmunólogos, pero con poca información disponible sobre las comunidades microbianas intestinales. Por lo tanto, nuestro objetivo fue describir la composición de la microbiota intestinal de bovinos Holstein Fasciola positivos y negativos utilizando métodos parasitológicos y ELISA (ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas). Se obtuvieron muestras de heces bovinas (n = 65) de mataderos de ganado en el altiplano colombiano de Cundi-Boyacense (una región hiperendémica para la fascioliasis bovina) y se estudiaron mediante secuenciación de genes 16S-rRNA y 18S-rRNA de próxima generación basada en amplicones. De estas muestras, 35 fueron negativas para Fasciola hepática y 30 fueron positivas para F. hepática en nuestro análisis de detección. Nuestros resultados mostraron una reducción en la abundancia relativa de Bacteroi detes y Ascomycota en las muestras positivas para Fasciola, junto con una disminución de la abundancia relativa de los taxones comensales previamente asociados con los procesos de fermentación y digestión. Sin embargo, los enfoques metabolómicos y los análisis funcionales de la microbiota intestinal son necesarios para respaldar estas hipótesis. Estos hallazgos son un pequeño primer paso en el desarrollo de investigaciones destinadas a comprender cómo se modulan las poblaciones microbianas en los bovinos en las infecciones por helmintos hepáticos.