Trabajo de grado - Maestría
Análisis de alteraciones moleculares de SPOP, FOXA1 e IDH1 en cáncer de próstata de población colombiana y sus posibles implicaciones en el pronóstico
Date
2021-04-23Registration in:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
Author
Montero Ovalle, Wendy Johana
Institutions
Abstract
El cáncer de próstata (CaP) es el tipo de cáncer con mayor incidencia y mortalidad en nuestro país. Los actuales marcadores del pronóstico de la enfermedad no diferencian los casos agresivos de los indolentes con suficiente certeza y por esto se ha trabajado en una caracterización por subtipos moleculares que permita tener una mejor clasificación. En CaP localizado de diferentes poblaciones se han detectado fusiones entre el gen regulado por andrógenos TMPRSS2 y ERG y mutaciones en genes como SPOP (speckle type POZ, el gen que codifica para una proteína adaptadora del complejo Cullin-3-RING-Box1), FOXA1 (factor de transcripción de Forkhead box-A1) e IDH1 (isocitrato deshidrogenasa 1), estas han sido relacionadas con el pronóstico; sin embargo, no se conoce la frecuencia y la relevancia de estas alteraciones en los pacientes con CaP en nuestro país.
En el presente estudio fueron evaluadas la fusión TMPRSS2-ERG y las mutaciones en SPOP, FOXA1 e IDH1 en muestras de tejidos fijados en formalina y embebidos en parafina (FFPE) de prostatectomías radicales de 112 pacientes con CaP, para determinar la frecuencia de estos subtipos y correlacionarlos con parámetros clínico-patológicos. La fusión fue detectada en 71 pacientes (63,4%), esta frecuencia del subtipo ERG fue similar a la observada en población caucásica (40-66%). Se encontraron diferencias estadísticamente significativas en el tiempo de recurrencia bioquímica de acuerdo con el seguimiento, entre 1-3 meses una gran proporción de pacientes con presencia de fusión tuvieron recurrencia bioquímica (40%) comparados con pacientes con ausencia (4,8%) (p=0,014). No se encontraron diferencias significativas entre otras variables clínico- patológicas y el estado de fusión. En los 41 (36,6%) casos negativos para la fusión, dos pacientes (4,9%) presentaron mutaciones de cambio de sentido con pérdida de función, en el exón 6 (p.F102C - c.305T>G) y en el exón 7 (p.F133L - c.399C>G) de SPOP, teniendo en cuenta todos los casos del estudio la presencia de este subtipo fue del 1,8%. La baja frecuencia de este subtipo en colombianos se podría explicar por la reportada variabilidad en la frecuencia de estas mutaciones según la población (5%-20%). No se encontraron mutaciones en FOXA1 en ninguna de las muestras analizadas. No fue posible estandarizar las técnicas para el análisis de las mutaciones de IDH1 en las muestras FFPE. (Texto tomado de la fuente) Prostate cancer (PCa) is the type of cancer with the highest incidence and mortality in our country. Current disease prognostic markers do not differentiate aggressive from indolent cases with sufficient certainty, and for this reason a characterization by molecular subtypes has been worked on that allow for a better classification. In localized PCa from different populations, fusions have been detected between the gene regulated by androgens TMPRSS2 and ERG and mutations in genes such as SPOP (Speckle type POZ, the gene that codes for an adapter protein of the Cullin-3-RING-Box1 complex), FOXA1 (Forkhead box-A1 transcription factor) and IDH1 (Isocitrate dehydrogenase 1), these have been related to prognosis; however, the frequency and relevance of these alterations in patients with PCa in our country is not known.
In the present study, the TMPRSS2-ERG fusion and the mutations in SPOP, FOXA1, and IDH1 were evaluated in samples of formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) tissues from radical prostatectomies of 112 patients with PCa, to determine the frequency of these subtypes. and correlate them with clinicopathological parameters. Fusion was detected in 71 patients (63.4%), this frequency of the ERG subtype was similar to that observed in the Caucasian population (40-66%). Statistically significant differences were found in the time of biochemical recurrence according to the follow-up, between 1-3 months a large proportion of patients with presence of fusion had biochemical recurrence (40%) compared with patients with absence (4.8%) (p=0.014). No significant differences were found between other clinicopathological variables and the state of fusion. In the 41 (36.6%) fusion-negative cases, two patients (4.9%) had missense mutations with loss of function, in exon 6 (p.F102C - c.305T> G) and in exon 7 (p.F133L - c.399C> G) of SPOP, taking all cases in this study, the presence of this subtype was 1.8%. The low frequency of this subtype in Colombians could be explained by the reported variability in the frequency of these mutations according to the population (5%-20%). No FOXA1 mutations were found in any of the samples tested. Techniques for the analysis of IDH1 mutations in FFPE samples could not be standardized. (Text taken from source)