Especies de Fusarium y Penicillium asociadas a frutales en los departamentos del Cauca y Valle de Cauca, Colombia

Abstract

La fruticultura mundial, y específicamente la colombiana, ha mostrado grandes avances, sin embargo, los problemas fitosanitarios siguen siendo una de los principales limitantes en la producción de los mismos. Entre los agentes patógenos que dificultan el establecimiento y desarrollo de los cultivo se encuentran algunas especies de hongos de los géneros Fusarium, Penicillum, las cuales son consideradas de importancia económica por los daños que generan a numerosos cultivos, entre los que se encuentran los frutales. Por ello, con el objetivo de caracterizar las poblaciones de estos géneros presentes en 35 cultivos de frutales, se realizó el procesamiento y siembra de 619 muestras de diferentes órganos afectados, las cuales fueron colectadas en 337 fincas ubicadas en 39 municipios del Valle del Cauca y 4 del Cauca. Luego, se seleccionaron y purificaron los aislamientos pertenecientes a los géneros de interés. A los cuales se les realizó la extracción de ADN y amplificación de la región ITS y TEF 1α. Posteriormente, los productos de PCR fueron enviados a macrogen, en Corea, para su secuenciación. Las secuencias obtenidas fueron comparadas con el NCBI (National Center for Biotecnology Information). Luego de realizar el procesamiento de las 619 muestras de tejidos vegetales, se realizó el aislamiento, purificación y caracterización morfológica de 116 aislados fúngicos del género Fusarium y uno del género Penicillum. Los resultados de la secuenciación de las regiones antes mencionadas, arrojaron que los aislamientos pertenecen a 12 especies de Fusarium (F. austroamericanum, F. chlamydosporum, F. concolor, F. decemcellulare, F. equiseti, F. fujikoroi, F. incarnatum, F. oxysporum, F. proliferatum F. solani, F. subglutinans, F. verticillioides) y una de Penicillum (Penicillum brocae) asociadas a los 19 de 35 frutales evaluados. El análisis de las relaciones filogenéticas realizado mediante el programa MEGA 6, usando el coeficiente de similitud del vecino más cercano, permitió observar una gran variabilidad entre los aislamientos evaluados.

//Abstract: The global fruit production, specifically Colombia, has shown great progress, however, phytosanitary problems remain one of the main problems in production. Among the pathogens that hinder the establishment and development of crops are some species of the genera Fusarium, Penicillium, which are considered of economic importance for damages generated in numerous crops, among which are the fruit. Therefore, in order to characterize the populations of these genera present in 35 crops of fruit, processing and sowing of 619 samples from different affected organs was performed, which were collected from 337 farms in 39 municipalities in the Valle del Cauca and 4 Cauca. Then selected and purified isolates belonging to the genera of interest and underwent DNA extraction and amplification of the ITS and TEF 1α region. Subsequently, the PCR products were sent to Macrogen (Korea) for sequencing. The sequences obtained were compared with the NCBI (National Center for Biotechnology Information). After performing the processing of 619 plant tissue samples; the isolation, purification and characterization of morphological 116 fungal isolates Fusarium and Penicillium genus was performed. The results of sequencing of the above regions, showed that the isolates belong to 12 species of Fusarium (F. austroamericanum, F. chlamydosporum, F. concolor, F. decemcellulare, F. equiseti, F. fujikoroi, F. incarnatum, F. oxysporum, F. solani F. proliferatum, F. subglutinans, F. verticillioides) and Penicillum (Penicillium brocae) associated with 19 of 35 fruit evaluated. The analysis of phylogenetic relationships performed using the MEGA program 6, using the similarity coefficient nearest neighbor, allowed to observe great variability among isolates evaluated.