Tesis
Caracterización de especies del género Fusarium asociadas a cultivos de banano Gros Michel en el departamento del Valle de Cauca.
Fecha
2018-11-11Autor
Higuita Valencia, Diana Marcela
Institución
Resumen
El cultivo de banano ocupa un lugar destacado en la producción agrícola a nivel mundial y en Colombia constituye el tercer producto más exportado. No obstante, a lo largo de la historia su producción ha sido amenazada por diferentes patógenos, entre los cuales, se destaca el hongo Fusarium oxysporum, agente causal de la marchitez o enfermedad de Panamá. El objetivo de la presente investigación fue caracterizar aislamientos del género Fusarium y los sistemas productivos asociados a cultivos de banano Gros Michel en el departamento del Valle del Cauca. Se tomaron muestras en los municipios de Alcalá, Sevilla y Caicedonia, que fueron analizadas en el Laboratorio de Diagnóstico Fitosanitario del ICA Seccional Valle del Cauca y se aplicaron encuestas para analizar el manejo del cultivo y la relación con la presencia de la enfermedad en los tres municipios. Se encontró el patógeno en 19 de las 33 fincas muestreadas luego de realizar procesos de aislamiento y caracterización morfológica. La identificación molecular de los diecinueve aislamientos se realizó por secuenciación del ADN asociado a la región ITS y al gen TEF-1α; las secuencias resultantes se compararon con las secuencias almacenadas en el Genbank. El análisis de las secuencias resultantes se realizó con el software MEGA 6, utilizando el coeficiente de similitud del vecino más cercano. La presencia de Fusarium oxysporum se confirmó en el 84% de los aislamientos obtenidos de las muestras procesadas. De acuerdo con las encuestas se encontró que la enfermedad está presente en los tres municipios objeto de estudio, los agricultores confunden los síntomas de la enfermedad con otras patologías y deficiencias nutricionales, además el medio de diseminación del patógeno más frecuente continúa siendo el material de propagación de la misma finca o de zonas afectadas por la enfermedad. //Abstract: Banana crop is one of the most important assets worldwide and for the Colombian economy is the third most traded export product. However, throughout the banana production history the crop has been threatened by several pathogenic agents, one of them is Fusarium oxysporum, which produces the banana vascular wilt also called Panama disease. The goal of this research is to characterize samples of Fusarium oxysporum isolated from soil in Valle del Cauca department. The samples were taken from the municipalities of Alcalá, Sevilla and Caicedonia, then the samples were analyzed in the Laboratory of Phytosanitary Diagnostic in Valle del Cauca, and finally a questionnaire was applied to farmers in order to analyze the crop management and its relationship with the disease presence. As a result of the isolation from farm soil samples and posterior morphological characterization the fungi was found in 19 out of 33 farms. The molecular identification of the 19 sampled farms was conducted by sequencing DNA associated with both ITS region and TEF-1α gene. The resulting sequences were compared with sequences deposited in Genbank. Analysis of sequences was processed with the software MEGA 6 and using the neighborhood similarity coefficient. Fusarium oxysporum presence was confirmed in 84% percent of the processed samples. Based on the questionnaire it is known that the disease is present in the three municipalities, the farmers confuse the Panama disease symptoms with other pathologies, and the most frequent spreading disease mechanism is dissemination material from contaminated farms.