dc.contributor | Avendaño Valenzuela, Catalina Esther, dir. | |
dc.creator | Sierra Durán, Natalia | |
dc.date.accessioned | 2019-04-02T15:25:31Z | |
dc.date.available | 2019-04-02T15:25:31Z | |
dc.date.created | 2019-04-02T15:25:31Z | |
dc.date.issued | 2018 | |
dc.identifier | https://repository.udca.edu.co/handle/11158/1337 | |
dc.identifier | MV021 S32e 2018 (205349) | |
dc.description.abstract | Cryptosporidiosis is a disease caused by Cryptosporidium spp that affects humans and a variety of vertebrate animals, being one of the most important causes of diarrhea and death in children and calves. One of the tools to know the potential of zoonotic distribution of circulating Cryptosporidium is the molecular characterization. For the most part, livestock are infected with Cryptosporidium parvum subtype IIa, the molecular characterization of circulating Cryptosporidium can allow the evaluation of zoonotic distribution potential, as well as determine if the geographical area and its specific environmental conditions can influence the genetic composition of the parasite, therefore, this work aimed to evaluate the association between the gp60 of Cryptosporidium parvum with the presentation of diarrhea, age of the calf and geographical region origin of the sample. For this work, 51 sequences of the gp60 glycoprotein of C. parvum amplified from fecal matter were analyzed, which came from calves coming from 51 farms of the Cundiboyacense region using work tools programs such as Bioedit, BLASTn, Genbank, Mega, Clustal, analyzing the sequences with Neighbor-Joining and Tajima's methods. As results, the distribution of the sequences was found to be homogeneous around the Cundiboyacense region, where subtype IIaA18G5R1 was the most found. There was no statistically significant relationship between gp60 and the variables proposed on this study. There is no treatment for this disease, which motivates every day to carry out new studies and to implement new preventive measures. | |
dc.description.abstract | La criptosporidiosis es una enfermedad causada por Cryptosporidium spp que afecta humanos y variedad de animales vertebrados, siendo una de las causas más importantes de diarrea y muerte en niños y terneros. Una de las herramientas para conocer el potencial de distribución zoonótico de Cryptosporidium circulante es su caracterización molecular. En su mayoría, el ganado se infecta con Cryptosporidium parvum subtipo IIa, la caracterización molecular de Cryptosporidium circulante puede permitir la evaluación del potencial de distribución zoonótico, asi mismo, determinar si el área geográfica y sus condiciones ambientales específicas pueden influir en la composición genética del parásito, por ende, este trabajo pretendió evaluar la asociación entre la gp60 de Cryptosporidium parvum con la presentación de diarrea, edad del ternero y región geográfica procedencia de la muestra. Para este trabajo, se analizaron 51 secuencias de la glicoproteína gp60 de C. parvum amplificada a partir de materia fecal, que provinieron de terneros procedentes de 51 fincas de la región Cundiboyacense usando herramientas de trabajo programas como Bioedit, BLASTn, Genbank, Mega, Clustal, analizando las secuencias con métodos Neighbor- Joining y Tajima´s. Como resultados, la distribución de las secuencias se halló homogénea alrededor de la región cundiboyacense, en donde el subtipo IIaA18G5R1 fue el más encontrado. No se presentó una relación estadísticamente significativa entre la gp 60 y las variables planteadas en este trabajo. No existe tratamiento de esta enfermedad lo que motiva día a día a realizar nuevos estudios y a la implementación de nuevas medidas preventivas. | |
dc.language | spa | |
dc.publisher | Bogotá : Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales, 2018 | |
dc.publisher | Facultad de Ciencias Agropecuarias | |
dc.publisher | Medicina Veterinaria | |
dc.relation | ALMEIDA CASTRO, A. P., BILBAO, G., ECHEVARRÍA, H., MORÁN, P., CATENA,
M., CACCIATTO, C., & MONTEAVARO, C. 2009. Cryptosporidiosis:
caracterización de la infección en terneros de rodeos lecheros. | |
dc.relation | AVENDAÑO, C. V., & Martínez, A. A. (2017). Caracterización molecular de los
subtipos de la GP60 de Cryptosporidium parvum y Cryptosporidium hominis
alrededor del mundo. Revista MVZ Córdoba, 22(3), 6339-6354. | |
dc.relation | AVENDAÑO, C., Quílez, J., & Sánchez-Acedo, C. (2010). Prevalence of
Cryptosporidium in calves in the Ubaté-Chiquinquirá Valley
(Colombia). Revista UDCA Actualidad & Divulgación Científica, 13(1), 41-
47. | |
dc.relation | BARCO, MD Compañ; GONZÁLEZ, A. Llopis; SUÁREZ-VARELA, MM Morales.
Consideraciones epidemiológicas sobre criptosporidiosis. Revista de
sanidad e higiene pública, 1991, vol. 65, no 4, p. 363-370. | |
dc.relation | BARRETO, Guillermo. The Introduction of Darwinism in
Venezuela. INTERCIENCIA-CARACAS-, 1994, vol. 19, p. 59-59 | |
dc.relation | BENHOUDA, D., Hakem, A., Sannella, A. R., Benhouda, A., & Cacciò, S. M.
(2017). First molecular investigation of Cryptosporidium spp. in young calves
in Algeria. Parasite, 24. | |
dc.relation | CACCIÒ, S. M., DE WAELE, V., & WIDMER, G. 2015. Geographical segregation
of Cryptosporidium parvum multilocus genotypes in Europe. Infection,
Genetics and Evolution, 31, 245-249. | |
dc.relation | CALL, M. L. T. (2001). Análisis de polimorfismos de ADN microsatélite de
cromosoma Y: estudio de la población de Galicia y aplicaciones
forenses (Doctoral dissertation, Universidade de Santiago de Compostela). | |
dc.relation | CAÑADAS, G., et al. Comprensión Del Test Chi-Cuadrado Por Estudiantes De
Psicología. Investigación en Educación Matemática, 2012, vol. 16, p. 153-
160. | |
dc.relation | CAPONI, Gustavo. Teleología Naturalizada (Naturalized Teleology): Los
conceptos de función, aptitud y adaptación en la Teoría de la Selección
Natural (The concepts of function, fitness and adaptation in Natural Selection Theory). THEORIA. Revista de Teoría, Historia y Fundamentos
de la Ciencia, 2013, vol. 28, no 1, p. 97-114. | |
dc.relation | CASTILLO, C. A. 2007. La selección natural a nivel molecular. Ecología
molecular, LE Eguiarte, V. Souza y X. Aguirre (eds.). Instituto Nacional de
Ecología, Semarnat, México, DF, 11-48. | |
dc.relation | CHACÍN-Bonilla, L., Barrios, F., & Sanchez, Y. (2007). Epidemiology of
Cyclospora cayetanensis infection in San Carlos Island, Venezuela: strong
association between socio-economic status and infection. Transactions of
the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene, 101(10), 1018-1024. | |
dc.relation | CERDA, J., & VILLARROEL DEL, L. 2007. Interpretación del test de Chicuadrado (X²) en investigación pediátrica. Revista chilena de
pediatría, 78(4), 414-417. | |
dc.relation | CÓRDOBA, A., BASUALDO FARJAT, J. Á., DRUT, R., SANTÍN, M., SIDOTI, A.,
& DEL COCO, V. 2011. Caracterización clínica e histopatológica de la
infección por el subtipo zoonótico IIa A21G1R1 de Cryptosporidium parvum
en modelo murino.Tercera Época, 2. | |
dc.relation | CHALMERS, R. M., Robinson, G., Elwin, K., Hadfield, S. J., Xiao, L., Ryan, U.,
... & Mallaghan, C. (2009). Cryptosporidium rabbit genotype, a newly
identified human pathogen. Emerging infectious diseases, 15(5), 829. | |
dc.relation | CLODE, P. L., Koh, W. H., & Thompson, R. A. (2015). Life without a host cell:
what is Cryptosporidium?. Trends in parasitology, 31(12), 614-624. | |
dc.relation | DE LA PARTE-PEREZ, Maria Antonia, et al. Cryptosporidium spp. y
criptosporidiosis. Revista de la sociedad Venezolana de microbiologia,
2005, vol. 25, no 1, p. 06-14 | |
dc.relation | DEL COCO, V. F., CÓRDOBA, M. A., & BASUALDO, J. A. 2009.
Criptosporidiosis: una zoonosis emergente. Revista argentina de
microbiología, 41(3), 185-196. | |
dc.relation | DEL COCO, V. F., CÓRDOBA, M. A., BILBAO, G., DE ALMEIDA CASTRO, A.
P., BASUALDO, J. A., FAYER, R., & SANTÍN, M. 2014. Cryptosporidium
parvum GP60 subtypes in dairy cattle from Buenos Aires,
Argentina. Research in veterinary science, 96(2), 311-314. | |
dc.relation | FAYER R. Taxonomy and species delimitation in Cryptosporidium. Exp Parasitol
2010;124(1):90–7. | |
dc.relation | FENG, Y., TORRES, E., LI, N., WANG, L., BOWMAN, D., & XIAO, L. 2013.
Population genetic characterisation of dominant Cryptosporidium parvum
subtype IIaA15G2R1. International journal for parasitology, 43(14), 1141-
1147. | |
dc.relation | GALVÁN, A. L., Magnet, A., Izquierdo, F., Vadillo, C. F., Peralta, R. H., Angulo,
S., ... & Del Aguila, C. (2014). A year-long study of Cryptosporidium species
and subtypes in recreational, drinking and wastewater from the central area
of Spain. Science of the Total Environment, 468, 368-375. | |
dc.relation | HALL, T. A. 1999, January. BioEdit: a user-friendly biological sequence
alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. In Nucleic
acids symposium series (Vol. 41, pp. 95-98). | |
dc.relation | HERMIDA, J. A. C., Warleta, M. G., & Mezo, M. (2015). La criptosporidiosis en
el ganado bovino. Albéitar: publicación veterinaria independiente, (187), 14-
16. | |
dc.relation | HERNÁNDEZ-Gallo, N., & Cortés-Vecino, J. A. (2010). Prevalencia y factores
de riesgo de Cryptosporidium spp. y Giardia spp. en terneros de ganado
lechero de la zona noroccidental de la Sabana de Bogotá. Revista de Salud
Pública, 14, 169-181. | |
dc.relation | HIJJAWI, N., Ng, J., Yang, R., Atoum, M. F., & Ryan, U. (2010). Identification of
rare and novel Cryptosporidium GP60 subtypes in human isolates from
Jordan. Experimental parasitology, 125(2), 161-164. | |
dc.relation | HOLSINGER, K. E. 2013. Tajima's D, Fu's FS, Fay and Wu's H, and Zeng et
al.'s E. | |
dc.relation | KHALIL, Shehla, et al. Cryptosporidium species subtypes and associated clinical
manifestations in Indian patients. Gastroenterology and Hepatology from
bed to bench, 2017, vol. 10, no 4, p. 311. | |
dc.relation | KLEIN, P., KLEINOVÁ, T., VOLEK, Z., & ŠIMŮNEK, J. 2008. Effect of
Cryptosporidium parvum infection on the absorptive capacity and
paracellular permeability of the small intestine in neonatal calves. Veterinary
parasitology,152(1), 53-59. | |
dc.relation | KORNELIUSSEN, T. S., Moltke, I., Albrechtsen, A., & Nielsen, R. (2013).
Calculation of Tajima’s D and other neutrality test statistics from low depth
next-generation sequencing data. BMC bioinformatics, 14(1), 289. | |
dc.relation | KVÁČ, M., KOUBA, M., & VÍTOVEC, J. 2006. Age-related and housingdependence of Cryptosporidium infection of calves from dairy and beef
herds in South Bohemia, Czech Republic. Veterinary parasitology, 137(3),
202-209. | |
dc.relation | LI, N., XIAO, L., CAMA, V. A., ORTEGA, Y., GILMAN, R. H., GUO, M., & FENG,
Y. 2013. Genetic recombination and Cryptosporidium hominis virulent
subtype IbA10G2. Emerg Infect Dis, 19(10), 1573-82. | |
dc.relation | MADDOX-HYTTEL, C., LANGKJÆR, R. B., ENEMARK, H. L., & VIGRE, H.
2006. Cryptosporidium and Giardia in different age groups of Danish cattle
and pigs—occurrence and management associated risk factors. Veterinary
parasitology,141(1), 48-59. | |
dc.relation | MARGUERITTE, J., Mattion, N., Blackhall, J., Fernández, F., Parreño, V.,
Vagnozzi, A., ... & Combessies, G. (2005). Diarrea neonatal en terneros de
rodeos de cría: su prevención y tratamiento. Sitio Argentino de Producción
Animal, 1, 11-13. | |
dc.relation | MARROQUÍN, M. M. E., Janeth, B. P. D., Carolina, G. M., & YeisonAndres, R.
C. (2018). Encephalitozoon cuniculi en conejo doméstico. reporte de un
caso. | |
dc.relation | MAZURIE, A. J., Alves, J. M., Ozaki, L. S., Zhou, S., Schwartz, D. C., & Buck,
G. A. (2013). Comparative genomics of Cryptosporidium. International
journal of genomics, 2013. | |
dc.relation | MOLINA, M., López, U., González, Z., Gómez, P., & Pezo, C. (2009).
Cryptosporidium parvum como factor de riesgo en la diarrea neonatal en
alpacas de Puno. Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú, 20(2),
263-269. | |
dc.relation | PEÑA, S. F. NEONATAL EN DOS REGIONES DE CHILE USANDO EL GEN
gp60 (2016). | |
dc.relation | PLUTZER, J., & KARANIS, P. 2009. Genetic polymorphism in Cryptosporidium
species: an update. Veterinary parasitology, 165(3), 187-199. | |
dc.relation | PUIU, D., ENOMOTO, S., BUCK, G. A., ABRAHAMSEN, M. S., & KISSINGER,
J. C. 2004. CryptoDB: the Cryptosporidium genome resource. Nucleic acids
research, 32(suppl 1), D329-D331. | |
dc.relation | PULIDO-Medellín, M. O., Andrade-Becerra, R. J., Rodríguez-Vivas, R. I., &
García-Corredor, D. J. (2014). Prevalencia y posibles factores de riesgo en
la excreción de ooquistes de Cryptosporidium spp en bovinos de Boyacá,
Colombia. Revista mexicana de ciencias pecuarias, 5(3), 357-364. | |
dc.relation | RAMÍREZ-Bello, J., Vargas-Alarcón, G., & Fragoso, J. M. (2013). Polimorfismos
de un solo nucleótido (SNP): implicaciones funcionales de los SNP
reguladores (rSNP) y de los SNP-ARN estructurales (srSNP) en
enfermedades complejas. Gaceta medica de Mexico, 149(2), 220-228. | |
dc.relation | RIDER, S. D., & ZHU, G. 2010. Cryptosporidium: genomic and biochemical
features. Experimental parasitology, 124(1), 2-9. | |
dc.relation | SÁNCHEZ, R., Romero, J., & Rossanigo, C. (2013). EPIDEMIOLOGÍA Y
CONTROL DE COCCIDIOS Y CRYPTOSPORIDIUM. | |
dc.relation | SULLIVAN, & Widmer, G., (2012). Genomics and population biology of
Cryptosporidium species. Parasite immunology, 34(2‐3), 61-71. | |
dc.relation | STERN, A., DORON-FAIGENBOIM, A., EREZ, E., MARTZ, E., BACHARACH,
E., PUPKO, T. SELECTON 2007: advanced models for detecting positive
and purifying selection using a Bayesian inference approach. Nucleic Acids
Research. 35: W506-W511. | |
dc.relation | STRIEPEN, B., WHITE, M. W., LI, C., GUERINI, M. N., MALIK, S. B.,
LOGSDON, J. M., ... & ABRAHAMSEN, M. S. 2002. Genetic
complementation in apicomplexan parasites. Proceedings of the National
Academy of Sciences, 99(9), 6304-6309. | |
dc.relation | STENSVOLD, C. R., Beser, J., Axén, C., & Lebbad, M. (2014). High applicability
of a novel method for gp60 subtyping of Cryptosporidium
meleagridis. Journal of clinical microbiology, JCM-00598. | |
dc.relation | STENSVOLD, Christen Rune, et al. High applicability of a novel method for gp60-
based subtyping of Cryptosporidium meleagridis. Journal of clinical
microbiology, 2014, vol. 52, no 7, p. 2311-2319. | |
dc.relation | TAJIMA, F. 1989. Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis
by DNA polymorphism. Genetics, 123(3), 585-595. | |
dc.relation | TAMURA, K., STECHER, G., PETERSON, D., FILIPSKI, A., & KUMAR, S. 2013.
MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular
biology and evolution, mst197. | |
dc.relation | TEAM, R. C. 2015. R: A Language and Environment for Statistical Computing
(R Foundation for Statistical Computing, Vienna, 2012). URL: http:// www.
R-project. org. | |
dc.relation | TOMAZIC, M. L., MAIDANA, J., DOMINGUEZ, M., URIARTE, E. L., GALARZA,
R., GARRO, C., ... & SCHNITTGER, L. 2013. Molecular characterization of
Cryptosporidium isolates from calves in Argentina. Veterinary
parasitology, 198(3), 382-386. | |
dc.relation | TROTZ-WILLIAMS, L. A., MARTIN, S. W., LESLIE, K. E., DUFFIELD, T.,
NYDAM, D. V., & PEREGRINE, A. S. 2007. Calf-level risk factors for
neonatal diarrhea and shedding of Cryptosporidium parvum in Ontario dairy
calves. Preventive veterinary medicine, 82(1), 12-28. | |
dc.relation | URIBARREN, T. B. CRYPTOSPORIDIOSIS o CRYPTOSPORIDIASIS o
. CRIPTOSPORIDIOSIS 2018;Recursos en Parasitología-Departamento de Microbiología y ParasitologíaUniversidad Nacional Autónoma de México. | |
dc.relation | WYATT, CAROL, RIGGS, MICHAEL W, et al Cryptosporidiosis in Neonatal
Calves, Veterinary Clinics of NA: Food Animal Practice 2010; 89-103-6. | |
dc.relation | VERGARA-Castiblanco, C., Sánchez-Acedo, C., Del Cacho, E., & LópezBernad, F. (2001). Prevalencia de Cryptosporidium parvum en ganado
caprino en la provincia de Zaragoza. Estudio preliminar. Acta Parasitol
Port, 8, 167. | |
dc.relation | XIAO, L. (2010). Molecular epidemiology of cryptosporidiosis: an
update. Experimental parasitology, 124(1), 80-89. | |
dc.relation | XIAO, L., Escalante, L., Yang, C., Sulaiman, I., Escalante, A. A., Montali, R. J.,
... & Lal, A. A. (1999). Phylogenetic analysis of Cryptosporidiumparasites
based on the small-subunit rRNA gene locus. Applied and environmental
microbiology, 65(4), 1578-1583. | |
dc.relation | ZANARO, N. L., & Garbossa, G. (2008). Cryptosporidium: cien años
después. Acta bioquímica clínica latinoamericana, 42(2), 195-201. | |
dc.relation | Agricultura | |
dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
dc.rights | Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0) | |
dc.rights | Derechos Reservados - Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales | |
dc.title | Evaluación de la asociación de la selección operante de la adhesina gp60 de cryptosporidium parvum con la presentación de diarrea, edad del ternero y región geográfica procedencia de la muestra | |
dc.type | Trabajo de grado - Pregrado | |