Artículos de revistas
Aplicación de técnicas moleculares a la filogenia de Aphyllophorales
Aplication of techniques molecular to phylogeny of Aphyllophorales
Registration in:
0556-6606
Author
Bracamonte, Lilian
Institutions
Abstract
Se determinó un método basado en las secuencias de adnr, para la detección e identificación de hongos Basidiomycetes pudridores
de madera en la Comunidad de Madrid, España. A partir de carpoforos frescos y cultivos de 46 especies de basidiomicetos, se
amplificó la región ITS, que comprende ITS1, 5.8S y ITS2, utilizando los cebadores ITS-1, ITS-4, ITS1-F y ITS4-B. Usando este método,
es posible la detección e identificación de hongos pudridores en muy poco tiempo sin necesidad de recurrir a la taxonomía
tradicional. Para evaluar las relaciones filogenéticas del género Rigidoporus se secuenciaron las regiones de ITS del ADNr de
120 muestras de herbario de 22 especies de este género. El producto de la PCR fue clonado y secuenciado. Las secuencias
fueron analizadas para conocer sus implicaciones taxonómicas y filogenéticos usando análisis de distancia, máxima parsimonia
y Bayesiano. Las especies de Rigidoporus usadas en este estudio fueron filogenéticamente heterogéneas. Estos análisis no
sustentaron la monofilia del género. Sin embargo un grupo de especies representado por Rigidoporus incurvus, R. biokoensis,
R. dextrinoides, R. microporus y otros están estrechamente relacionados en un mismo clado. Otras especies de Rigidoporus
incluyendo R. undatus, R. lineatus, R. crocatus, R. vinctus no se incluyeron en este grupo. 114 bracamon@ula.ve semestral It was determined a method for molecular diagnostics based on the ribosomal DNA sequences, for the detection and identification
of Basidiomycetes fungi that are wood decay in Madrid, Spain. From carpophoros and cultures coming from 46 species of
basidiomycetes, it was amplified the ITS region, which compromised ITS1, 5, 8, and ITS2, using the oligonucleotides ITS-1, ITS-4,
ITS1-F y ITS4-B. Using this method detection and identification of fungi rot it is possible in a few times without use classical taxonomy
methods. For evaluation of phylogenetic relationship of Rigidoporus genus, ribosomal DNA ITS regions were sequenced from
120 herbaria specimens of 22 species of this genus. The PCR product was cloned and sequenced. The sequences were analyzed to
know its taxonomic and phylogenetic implications using analysis methods of the distance, maximum parsimony and Bayesiano.
The species of Rigidoporus used at this study were phylogenetically heterogeneous. Those analysis don´t show the monophyly
of the genus. However a group of species represented by Rigidoporus incurvus, R. biokoensis, R. dextrinoides, R. microporus
and others are very close related in the same clado. Other species of Rigidoporus including R. undatus, R. lineatus, R. crocatus,
R. vinctus are not included inside this group.