Aplicación de técnicas moleculares a la filogenia de Aphyllophorales

Aplication of techniques molecular to phylogeny of Aphyllophorales

dc.creatorBracamonte, Lilian
dc.date2010-04-15T15:15:30Z
dc.date2010-04-15T15:15:30Z
dc.date2009-06-30
dc.date.accessioned2017-03-03T14:26:09Z
dc.date.available2017-03-03T14:26:09Z
dc.identifier0556-6606
dc.identifierhttp://www.saber.ula.ve/handle/123456789/30846
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/213983
dc.descriptionSe determinó un método basado en las secuencias de adnr, para la detección e identificación de hongos Basidiomycetes pudridores de madera en la Comunidad de Madrid, España. A partir de carpoforos frescos y cultivos de 46 especies de basidiomicetos, se amplificó la región ITS, que comprende ITS1, 5.8S y ITS2, utilizando los cebadores ITS-1, ITS-4, ITS1-F y ITS4-B. Usando este método, es posible la detección e identificación de hongos pudridores en muy poco tiempo sin necesidad de recurrir a la taxonomía tradicional. Para evaluar las relaciones filogenéticas del género Rigidoporus se secuenciaron las regiones de ITS del ADNr de 120 muestras de herbario de 22 especies de este género. El producto de la PCR fue clonado y secuenciado. Las secuencias fueron analizadas para conocer sus implicaciones taxonómicas y filogenéticos usando análisis de distancia, máxima parsimonia y Bayesiano. Las especies de Rigidoporus usadas en este estudio fueron filogenéticamente heterogéneas. Estos análisis no sustentaron la monofilia del género. Sin embargo un grupo de especies representado por Rigidoporus incurvus, R. biokoensis, R. dextrinoides, R. microporus y otros están estrechamente relacionados en un mismo clado. Otras especies de Rigidoporus incluyendo R. undatus, R. lineatus, R. crocatus, R. vinctus no se incluyeron en este grupo.
dc.description114
dc.descriptionbracamon@ula.ve
dc.descriptionsemestral
dc.descriptionIt was determined a method for molecular diagnostics based on the ribosomal DNA sequences, for the detection and identification of Basidiomycetes fungi that are wood decay in Madrid, Spain. From carpophoros and cultures coming from 46 species of basidiomycetes, it was amplified the ITS region, which compromised ITS1, 5, 8, and ITS2, using the oligonucleotides ITS-1, ITS-4, ITS1-F y ITS4-B. Using this method detection and identification of fungi rot it is possible in a few times without use classical taxonomy methods. For evaluation of phylogenetic relationship of Rigidoporus genus, ribosomal DNA ITS regions were sequenced from 120 herbaria specimens of 22 species of this genus. The PCR product was cloned and sequenced. The sequences were analyzed to know its taxonomic and phylogenetic implications using analysis methods of the distance, maximum parsimony and Bayesiano. The species of Rigidoporus used at this study were phylogenetically heterogeneous. Those analysis don´t show the monophyly of the genus. However a group of species represented by Rigidoporus incurvus, R. biokoensis, R. dextrinoides, R. microporus and others are very close related in the same clado. Other species of Rigidoporus including R. undatus, R. lineatus, R. crocatus, R. vinctus are not included inside this group.
dc.languagees
dc.publisherSABER ULA
dc.publisherVenezuela
dc.subjectITS
dc.subjectBasidiomycetes
dc.subjectRigidoporus
dc.subjectFacultad de Ciencias Forestales y Ambientales
dc.subjectITS
dc.subjectBasidiomycetes
dc.subjectRigidoporus
dc.subjectRevista Forestal Venezolana: Tesis
dc.subjectRevista Forestal Venezolana
dc.subjectGeografía
dc.subjectMedio Ambiente
dc.subjectRevistas
dc.titleAplicación de técnicas moleculares a la filogenia de Aphyllophorales
dc.titleAplication of techniques molecular to phylogeny of Aphyllophorales
dc.typeArtículos de revistas


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