Tesis Doctorado
Caracterización genéetica de los componentes de la ruta de degradación del 2,4,6-triclorofenol en cupriavidus necator jmp134 (pjp4)
Autor
Gonzáez-Ojeda, Bernardo
Pontificia Universidad Católica de Chile
Institución
Resumen
La actividad agroforestal e industrial libera al ambiente compuestos organoclorados cuya
presencia para la biota es peligrosa debido a su elevada toxicidad y resistencia a la degradación. Entre
los compuestos organoclorados están los clorofenoles, los que, por su empleo como biocidas, por ser
producidos durante el blanqueo de la pulpa de celulosa con cloro o por ser intermediarios del
metabolismo de otros compuestos cloroaromáticos, han sido liberados en suelos, ríos y sedimentos.
Varios estudios han descrito la caracterización de bacterias que utilizan algunos compuestos mono y
diclorados como única fuente de carbono y energía, conociéndose tanto las enzimas como los genes de
las vías degradativas involucradas. Respecto a la degradación de triclorofenoles se dispone de escasa
información acerca de los genes y enzimas responsables de este proceso.
Cupriavidus necator JMP134 (pJP4) es una bacteria aislada desde suelo contaminado con
cloroaromáticos, bien estudiada por su capacidad para degradar una gran variedad de compuestos
mono y diclorados. Además, se ha descrito que esta bacteria degrada completamente 2,4,6-triclorofenol
(2,4,6-TCF), conociéndose bien la vía degradativa pero no los genes involucrados. La vía es iniciada
por la conversión de 2,4,6-TCF a 2,6-dicloro-p-hidroquinona, y luego a 6-clorohidroxiquinol (6-CHa),
ambos pasos catalizados por la actividad triclorofenol monooxigenasa. El 6-CHQ es transformado a 2-
cloromaleilacetato por la actividad hidroxiquinol dioxigenasa, y el 2-cloromaleilacetato es convertido a 3-
oxoadipato por la actividad maleilacetato reductasa (MAR), para luego empalmar con el ciclo de Krebs.
Las primeras enzimas que participan en la degradación del clorofenol han sido caracterizadas y los
correspondientes genes, tcpA y tcpC, han sido donados y secuenciados. Estos genes se encuentran
formando un putativo operón catabólico tcpRXABCYD. En este trabajo de tesis se estudiaron los genes
de este putativo operón. Para ello todos los genes tcp fueron individualmente inactivados y las cepas
mutantes fueron evaluadas por sus capacidad para crecer y degradar 2,4,6-TCF. Además, se evaluó la posible participación de otros genes y marcos de lectura abiertos presentes en el genoma de la cepa
JMP134, que codificarían para funciones homólogas a las de los genes tcp.