Atividade antiviral de extratos produzidos de bactérias isoladas e coletadas em cupinzeiros frente a vírus de importância humana e animal = Antiviral activity of extracts produced by isolated bacteria collected in termite mounds against important human and animal viruses
Antiviral activity of extracts produced by isolated bacteria collected in termite mounds against important human and animal viruses
| dc.creator | Padilla, Marina Aiello, 1986- | |
| dc.date | 2015 | |
| dc.date | 2015-04-12T00:00:00Z | |
| dc.date | 2017-04-03T03:19:25Z | |
| dc.date | 2017-07-19T12:52:10Z | |
| dc.date | 2017-04-03T03:19:25Z | |
| dc.date | 2017-07-19T12:52:10Z | |
| dc.date.accessioned | 2018-03-29T04:35:16Z | |
| dc.date.available | 2018-03-29T04:35:16Z | |
| dc.identifier | PADILLA, Marina Aiello. Atividade antiviral de extratos produzidos de bactérias isoladas e coletadas em cupinzeiros frente a vírus de importância humana e animal = Antiviral activity of extracts produced by isolated bacteria collected in termite mounds against important human and animal viruses. 2015. 1 recurso online ( 102 p.). Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: <http://www.bibliotecadigital.unicamp.br/document/?code=000963637>. Acesso em: 3 abr. 2017. | |
| dc.identifier | http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/316636 | |
| dc.identifier.uri | http://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/1347938 | |
| dc.description | Orientadores: Clarice Weis Arns, Luciana Konecny Kohn | |
| dc.description | Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia | |
| dc.description | Resumo: As infecções virais acometem tanto humanos quanto animais. Problemas associados a falta de vacinas e o desenvolvimento de resistência aos medicamentos estimulam a pesquisa por compostos antivirais. As bactérias são responsáveis pela produção de inúmeros compostos com atividades biológicas importantes, portanto, esse trabalho teve como objetivo a busca por compostos antivirais produzidos por bactérias coletadas em cupinzeiros. Extratos provenientes de diferentes isolados de bactérias associadas ao cupim foram avaliados quanto a atividade antiviral in vitro frente a três vírus de importância para a saúde humana e animal: herpes humano tipo 1 (HHV-1), calicivírus felino (FCV)- modelo para o norovírus humano - e o vírus da diarréia viral bovina (BVDV) ¿ modelo para o vírus da hepatite C. Dos 90 extratos analisados, 10% apresentaram porcentagem de inibição (PI%) ? 98% contra pelo menos um dos vírus: cinco foram ativos frente ao HHV-1, três apresentaram atividade contra o FCV e dois foram ativos frente ao BVDV. Das espécies ativas, seis pertencem ao gênero Streptomyces, com uma delas identificada como S. chartreusis e quatro identificadas como sendo do gênero Achromobacter. Três extratos apresentaram índice de seletividade (IS) acima de 3,5 contra o HHV-1 com destaque ao CDPA10 (Streptomyces sp) com IS=17,10. Frente ao FCV e o BVDV dois extratos foram considerados promissores: o LC22 (IS=11,00), identificado como Streptomyces sp e o CDPA27 (S. chartreusis) com IS=3,5, respectivamente. Os extratos que destacaram-se quanto aos valores e IS foram também avaliados em uma triagem de mecanismo de ação. Dos três extratos com IS acima de 3,5 frente ao HHV-1, um apresentou atividade antiviral no pós tratamento. Os outros, incluindo o CDPA10 agem como inativadores virais. O extrato LC22, ativo contra o FCV apresentou atividade no pós tratamento e também como inativador viral. Por fim, o extrato proveniente do S. chartreusis (CDPA27), agiu no pós tratamento frente ao BVDV. Esses três extratos, CDPA10, LC22 e CDPA27 foram selecionados para o fracionamento em coluna C18 fase reversa em ordem crescente de metanol, originando seis frações. Todas as frações foram avaliadas contra seus respectivos vírus e como resultado foi possível observar que a fração 6 (100% metanol) foi a mais promissora dos três extratos. Essa fração do CDPA10 e do CDPA27, ativos contra o HHV-1 e BVDV respectivamente, apresentaram valor de PI=99%, enquanto a fração 6 do extrato LC22 (ativo contra o FCV) apresentou PI=90%. Nas avaliações quanto ao IS dessas frações promissoras, observou-se que os valores aumentaram consideravelmente tanto para o CDPA10 como para o CDPA27, já a fração do LC22 teve o valor de IS reduzido para 3,24. Finalmente, todos os extratos e suas frações promissoras foram analisados por cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massa (CG-MS). Esta análise, quando comparada aos compostos já descritos na biblioteca NIST/2005, não permitiu a identificação dos compostos devido a baixa similaridade. Estudos mais detalhados devem ser realizados a fim de identificar as espécies bacterianas e seus respectivos compostos ativos. Os resultados obtidos revelam novas perspectivas para a pesquisa antiviral a partir de produtos naturais e demonstra o potencial antiviral de compostos produzidos por bacterias associadas ao cupim | |
| dc.description | Abstract: Viral infections affect both humans and animals. Problems associated with a lack of vaccines and development of drug resistance stimulates the research for antiviral compounds. Bacteria are responsible for producing many compounds with important biological activities, so this study aimed to research for antiviral compounds produced by isolated associated bacteria. Extracts from different isolated termite associated bacteria were evaluated for in vitro antiviral activity against three important viruses to human and animal health: human herpesvirus type 1 (HHV-1), feline calicivirus (FCV) - surrogate model for human norovirus -and bovine viral diarrhea virus (BVDV) - surrogate model for hepatitis C virus. Of 90 extracts analyzed, 10% had percentage of inhibition (PI%) ? 98% against at least one virus: five were active against HHV-1, three showed activity against FCV and two were active against BVDV. Of the active species, six belong to Streptomyces genus, with one of them identified as S. chartreusis and four were identified as Achromobacter genus. Three extracts showed selectivity index (SI) above 3.5 against HHV-1, highlighting CDPA10 (Streptomyces sp) with SI = 17.10. Against the FCV and BVDV only two extracts were considered promising: LC22 (SI = 11.00), identified as Streptomyces sp and CDPA27 (S. chartreusis) with SI = 3.5, respectively. The extracts that stood out about the values of SI were also evaluated in a screening of mechanism of action. Of the three extracts with SI above 3.5 against HHV-1, only one showed antiviral activity in post-treatment, the others, including CDPA10 act as virus inactivation. The LC22, extract active against FCV, showed activity in the post-treatment as well as virus inactivation. Finally, the extract from S. chartreusis (CDPA27), acted in the post-treatment against BVDV. These three extracts CDPA10, LC22 and CDPA27 were then selected for fractionation on column C18 phase reverse with ascending order of methanol, resulting in six fractions. All fractions were evaluated against the respective virus and as a result was observed that the fraction 6 (100% methanol) were the most promising of the three extracts. That fraction of CDPA10 and CDPA27, active against HHV-1 and BVDV respectively, presented value of PI = 99%, while the fraction 6 of LC22 extract (active against FCV) presented PI = 90%. The SI evaluations of these promising fractions showed that the values increased substantially for both CDPA10 and CDPA27; however the fraction of LC22 extract had reduced SI value to 3.24. Finally, all extracts and their promising fractions were analyzed by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS). This analysis, when compared to the compounds already described in the NIST / 2005 library, it was not possible to identify them due to low similarity. More detailed studies should be performed to identify the bacterial species and their active compounds. The result of the present study provide new information for antiviral research using natural sources and demonstrates antiviral potential of compounds produced by termite associated bacteria | |
| dc.description | Doutorado | |
| dc.description | Microbiologia | |
| dc.description | Doutora em Genética e Biologia Molecular | |
| dc.description | 143469/2011-8 | |
| dc.description | 11/08962-0 | |
| dc.description | CNPQ | |
| dc.description | FAPESP | |
| dc.format | 1 recurso online ( 102 p.) : il., digital, arquivo PDF. | |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.publisher | [s.n.] | |
| dc.relation | Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDF | |
| dc.subject | Agentes antivirais | |
| dc.subject | Térmita | |
| dc.subject | Bactérias | |
| dc.subject | Herpesvirus humano 1 | |
| dc.subject | Calicivirus felino | |
| dc.subject | Vírus da diarréia viral bovina | |
| dc.subject | Streptomyces | |
| dc.subject | Antiviral agents | |
| dc.subject | Térmites | |
| dc.subject | Bacteria | |
| dc.subject | Herpesvirus 1, Human | |
| dc.subject | Calicivirus, Feline | |
| dc.subject | Diarrhea viruses, Bovine viral | |
| dc.subject | Streptomyces | |
| dc.title | Atividade antiviral de extratos produzidos de bactérias isoladas e coletadas em cupinzeiros frente a vírus de importância humana e animal = Antiviral activity of extracts produced by isolated bacteria collected in termite mounds against important human and animal viruses | |
| dc.title | Antiviral activity of extracts produced by isolated bacteria collected in termite mounds against important human and animal viruses | |
| dc.type | Tesis |