| dc.creator | Salgado, Caio Césio | |
| dc.creator | Cruz, Cosme Damião | |
| dc.creator | Nascimento, Moysés | |
| dc.creator | Barrera, Carlos Felipe Sanches | |
| dc.date | 2018-03-12T10:57:03Z | |
| dc.date | 2018-03-12T10:57:03Z | |
| dc.date | 2010-10-20 | |
| dc.date.accessioned | 2023-09-27T21:30:24Z | |
| dc.date.available | 2023-09-27T21:30:24Z | |
| dc.identifier | 16783921 | |
| dc.identifier | http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2011000100009 | |
| dc.identifier | http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/18174 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8961761 | |
| dc.description | O objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro novos mapas: três com oito marcadores e um com nove marcadores, cada qual com quatro marcadores âncoras. Os mapas foram alinhados, ordenados, integrados e, em seguida, comparados ao mapa de origem. O processo de integração de mapas proposto mostrou-se eficiente. Os mapas gerados tiveram pequena tensão interna em comparação aos mapas dos quais se originaram. A integração de mapas depende do tipo de população utilizada, tamanho da população, tipo de marcador, da frequência de recombinação e da fase de ligação. | |
| dc.description | The objective of this work was to develop an integration process of genetic maps using the inverse variance, and to test its efficiency. Simulated F2 codominant populations and backcrosses of 100, 150, 200, and 400 plants were used, considering a virtual diploid species with 2n = 2x = 2 chromosomes, with total genome length per linkage group estipulated in 100 cM, 21 marks per linkage group, and equidistant markers spaced at 5 cM. The genomes were compared for linkage group size, distance variance between adjacent marks, Spearman correlation and stress related to the estimated distances adequation. Each simulated genome was fragmented into four new maps: three with eight makers and one with nine, each containing four anchor markers. The maps were aligned, ordered, integrated and, then, compared with the original map. The proposed map integration process proved to be effective. The generated maps showed a little internal tension in comparison to the original ones. Map integration depends on the population type, population size, marker type, recombination frequency, and on the linkage phase. | |
| dc.format | pdf | |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | por | |
| dc.publisher | Pesquisa Agropecuária Brasileira | |
| dc.relation | v. 46, n. 1, p. 66-73, Janeiro 2011 | |
| dc.rights | Open Access | |
| dc.subject | Frequência de recombinação | |
| dc.subject | Grupos de ligação | |
| dc.subject | Marcador molecular | |
| dc.subject | Tensão interna | |
| dc.title | O uso da variância como metodologia alternativa para integração de mapas genéticos | |
| dc.type | Artigo | |
