Identificação, caracterização e análise de expressão de genes que codificam peptidil sintases não-ribossomais em Colletotrichum lindemuthianum
NRPSs’ study in Colletotrichum lindemuthianum: Identification, Characterization and Functional Analysis
| dc.contributor | Queiroz, Marisa Vieira de | |
| dc.contributor | http://lattes.cnpq.br/5718975445923498 | |
| dc.contributor | Bazzolli, Denise Mara Soares | |
| dc.creator | Correia, Hilberty Lucas Nunes | |
| dc.date | 2023-09-26T13:54:34Z | |
| dc.date | 2023-09-26T13:54:34Z | |
| dc.date | 2016-02-23 | |
| dc.date.accessioned | 2023-09-27T21:19:24Z | |
| dc.date.available | 2023-09-27T21:19:24Z | |
| dc.identifier | CORREIA, Hilberty Lucas Nunes. Identificação, caracterização e análise de expressão de genes que codificam peptidil sintases não-ribossomais em Colletotrichum lindemuthianum. 2016. 43 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2016. | |
| dc.identifier | https://locus.ufv.br//handle/123456789/31576 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8958646 | |
| dc.description | Os fungos em geral, são grandes produtores de metabólitos secundários, que são compostos com funções e estruturas altamente diversas, não requeridos para o crescimento. Dentre os metabólitos secundários destaca-se a classe dos peptídeos não- ribossomais (NRPs), que são polímeros de aminoácidos proteinogênicos e não- proteinogênicos, hidroxiácidos e ácidos carboxílicos. Esta classe de metabólitos é sintetizada pelo mecanismo de auto-molde pela atividade de grandes complexos enzimáticos multidomínios e multimodulares, denominados peptidil sintetases não- ribossomais (NRPSs). Entre as funções de peptídeos não-ribossomais já relatadas estão: imunossupressão, papel de toxinas envolvidas na patogênese, quelação de ferro e etc. O presente trabalho teve como objetivo realizar a identificação e caracterização das NRPSs em Colletotrichum spp. Além disso, foi realizada a análise da expressão dos genes que codificam NRPSs em Colletotrichum lindemuthianum, agente etiológico da antracnose do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Foram identificados os genes que codificam NRPSs nos genomas de C. lindemuthianum (isolados 83, 89 e 7R), Colletotrichum fioriniae, C. glosporioides C. graminicola, C. higginsianum e C. orbiculare. O número de genes que codificam NRPSs identificadas variou para cada genoma em questão de 6 a 22. Todos os genes que codificam NRPSs foram encontrados como parte de agrupamentos contendo genes que codificam outras enzimas biossintéticas. A análise filogenética utilizando sequências dos domínios A indicou uma grande diversidade de NRPSs em Colletotrichum spp., sendo que algumas destas são ortólogas de proteínas responsáveis pela síntese de produtos relacionados à virulência de fitopatógenos como NPS6 e Hts1. Em C. lindemuthianum foram encontradas nove NRPSs, sendo duas destas ortólogas de Hts1 e NPS6. Apenas uma das NRPSs aqui identificadas é específica para a espécie C. lindemuthianum. A análise dos transcritos de C. lindemuthianum nas diferentes fases de desenvolvimento em plantas de feijoeiro e in vitro revelou que todos estes genes são expressos em ao menos uma das fases de desenvolvimento do fungo. | |
| dc.description | ungi in general, are major producers of secondary metabolites that are highly diverse in functions and structures, but are not required for growth. Among the secondary metabolites there is the class of non-ribosomal peptides (NRPs), which consist of polymers of proteogenic and non-proteogenic amino acids, hydroxy and carboxylic acids. This class of metabolites is synthesized through the thiotemplate mechanism by large enzyme complex multidomain and multimodulares, called peptidyl synthetase non- ribosomal (NRPSs). This study aimed to carry out the identification, and characterization analysis of NRPSs in Colletotrichum spp. In addition, it performed an analysis of the expression of genes encoding NRPSs in Colletotrichum lindemuthianum, causal agent of bean (Phaseolus vulgaris) anthracnose. The NRPSs have been identified in the genomes of C. lindemuthianum (isolates 83, 89 and 7R) C. fioriniae, C. glosporioides C. graminicola, C. higginsianum and C. orbiculare. The number of identified NRPSs varied from 6 to 22, per genome in question. All NRPSs genes were found as part of clusters containing other biosynthetic enzymes. Phylogenetic analysis indicated a wide range of NRPSs with Colletotrichum spp., and some of these are orthologous of proteins responsible for plant pathogens virulence related products production such as NPS6 HTS1. In Colletotrichum lindemuthianum was found 9 NRPSs’ genes, some of them are orthologous of Hts1 and NPS6. Here was detected the expression of all genes NRPSs at least in one of the development stages evaluated in this study. | |
| dc.description | CNPQ -Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico | |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | por | |
| dc.publisher | Universidade Federal de Viçosa | |
| dc.publisher | Microbiologia Agrícola | |
| dc.rights | Acesso Aberto | |
| dc.subject | Fungos fitopatôgenicos | |
| dc.subject | Colletotrichum lindemuthianum | |
| dc.subject | Metabolismo secundário | |
| dc.subject | Expressão gênica | |
| dc.subject | Virulência (Microbiologia) | |
| dc.subject | Feijão - Doenças e pragas | |
| dc.subject | Antracnose | |
| dc.subject | Ciencias Agrárias | |
| dc.title | Identificação, caracterização e análise de expressão de genes que codificam peptidil sintases não-ribossomais em Colletotrichum lindemuthianum | |
| dc.title | NRPSs’ study in Colletotrichum lindemuthianum: Identification, Characterization and Functional Analysis | |
| dc.type | Dissertação |