Variação intragenômica de rDNA em Carapichea ipecacuanha (Rubiaceae): evolução em concerto incompleta e pseudogenes

Intragenomic variability of rDNA in Carapichea ipecacuanha (Rubiaceae): incompleted concerted evolution and pseudogenes

dc.contributorhttp://lattes.cnpq.br/8554664264304438
dc.contributorYotoko, Karla Suemy Clemente
dc.contributorhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763141P7
dc.contributorSantos, Jorge Abdala Dergam dos
dc.contributorhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780131D9
dc.contributorOliveira, Luiz Orlando de
dc.contributorhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781626T2
dc.contributorSalomão, Tânia Maria Fernandes
dc.contributorhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787017A5
dc.contributorFietto, Juliana Lopes Rangel
dc.contributorhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4790238D0
dc.creatorQueiroz, Camila de Sousa
dc.date2015-03-26T13:42:15Z
dc.date2011-06-07
dc.date2015-03-26T13:42:15Z
dc.date2010-02-24
dc.date.accessioned2023-09-27T21:18:31Z
dc.date.available2023-09-27T21:18:31Z
dc.identifierQUEIROZ, Camila de Sousa. Intragenomic variability of rDNA in Carapichea ipecacuanha (Rubiaceae): incompleted concerted evolution and pseudogenes. 2010. 42 f. Dissertação (Mestrado em Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2010.
dc.identifierhttp://locus.ufv.br/handle/123456789/4722
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8958379
dc.descriptionA investigação da variação intra-individual do cistron de rDNA ITS em Carapichea ipecacuanha foi realizada a partir de seqüenciamento direto de fragmentos de PCR de 26 indivíduos e do seqüenciamento de 240 clones, representando outros 51 indivíduos. As estruturas secundárias das regiões 5.8S e ITS2 apresentam as configurações típicas presentes em angiospermas respectivamente em 20 e 48 haplótipos encontrados. A comparação com os motivos conservados em angiospermas e as estruturas secundárias obtidas para a região 5.8S, indicadores mais confiáveis da funcionalidade das seqüências em C. ipecacuanha, permitiram a identificação de 13 pseudogenes entre os 26 haplótipos de 5.8S encontrados. A análise da estrutura secundária do ITS2 adicionou um haplótipo ao conjunto de pseudogenes. A perda de funcionalidade em alguns haplótipos deve ser mais antiga do que em outros em razão do acúmulo de maior número de substituições e da formação de grupos de pseudogenes pertencentes a populações distintas.
dc.descriptionThe investigation of intra-individual variation of the rDNA cistron ITS in Carapichea ipecacuanha was made from direct sequencing of 26 individuals and from sequencing of 240 clones, representing another 51 individuals. The secondary structures of 5.8S and ITS2 regions show the typical configurations present in angiosperms respectively for 20 and 48 haplotypes. The comparison with the conserved motifs in angiosperms and the secondary structures obtained for the 5.8S region, the most reliable markers of functional sequences in C. ipecacuanha, allowed the identification of 13 pseudogenes among 26 haplotypes of 5.8S. The analysis of the secondary structure of ITS2 added one haplotype to the set of pseudogenes. The loss of functionality in some haplotypes has occurred prior to the others copies due to the accumulation of a larger number of substitutions and the formation of groups of pseudogenes that belong to distinct populations.
dc.descriptionConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.languagepor
dc.publisherUniversidade Federal de Viçosa
dc.publisherBR
dc.publisherGenética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me
dc.publisherMestrado em Genética e Melhoramento
dc.publisherUFV
dc.rightsAcesso Aberto
dc.subjectCarapichea ipecacuanha
dc.subjectITS
dc.subjectVariação intragenômica
dc.subjectEstrutura secundária
dc.subjectPseudogenes
dc.subjectCarapichea ipecacuanha
dc.subjectITS
dc.subjectIntragenomic variation
dc.subjectSecondary structures
dc.subjectPseudogenes
dc.subjectCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOS
dc.titleVariação intragenômica de rDNA em Carapichea ipecacuanha (Rubiaceae): evolução em concerto incompleta e pseudogenes
dc.titleIntragenomic variability of rDNA in Carapichea ipecacuanha (Rubiaceae): incompleted concerted evolution and pseudogenes
dc.typeDissertação


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