Use of the IRAP marker to study genetic variability in Pseudocercospora fijiensis populations

Queiroz, Casley Borges de

dc.contributor	http://lattes.cnpq.br/0922107268691629
dc.contributor	Araujo, Elza Fernandes de
dc.contributor	http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783675E2
dc.contributor	Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide
dc.contributor	http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785633J8
dc.contributor	Queiroz, Marisa Vieira de
dc.contributor	http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4785812Z5
dc.contributor	Ribon, Andréa de Oliveira Barros
dc.contributor	http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4727026E6
dc.creator	Queiroz, Casley Borges de
dc.date	2015-03-26T13:51:59Z
dc.date	2014-09-01
dc.date	2015-03-26T13:51:59Z
dc.date	2013-03-22
dc.date.accessioned	2023-09-27T20:50:51Z
dc.date.available	2023-09-27T20:50:51Z
dc.identifier	QUEIROZ, Casley Borges de. Use of the IRAP marker to study genetic variability in Pseudocercospora fijiensis populations. 2013. 44 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2013.
dc.identifier	http://locus.ufv.br/handle/123456789/5365
dc.identifier.uri	https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8949294
dc.description	Devido à ausência de estudo de caracterização da variabilidade genética das populações de Pseudocercospora fijiensis recentemente introduzidas no Brasil, o objetivo desse trabalho foi avaliar a adequabilidade do marcador IRAP para estudar variações genéticas entre indivíduos, bem como determinar a estrutura genética da população brasileira de P. fijiensis com base no fingerprinting gerado por amplificação de polimorfismo entre retrotransposons (IRAP). Um total de 22 locos foi amplificado, sendo 77.3 % polimórficos. A análise de agrupamento revelou dois principais grupos no Brasil. A diversidade gênica (HE) foi de 0.22 e pela análise de variância molecular verificou-se que a maior variabilidade genética está dentro das populações. A Análise Discriminante de Componente Principal (DAPC) revelou que não há nenhuma estruturação relacionada com as origens geográficas e cultiva hospedeiro. O sistema de marcador baseado em retrotransposon IRAP é ferramenta apropriada para estudar a variabilidade genética em P. fijiensis.
dc.description	Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
dc.description	Due to the lack of characterization study of genetic variability in populations of Pseudocercospora fijiensis recently introduced in Brazil, the objective of this study was to evaluate the suitability of IRAP marker for studying genetic variations between individuals, and to determine the genetic structure of the population of P. fijiensis based on fingerprinting generated by inter-retrotransposons amplified polymorphism (IRAP). A total of 22 loci were amplified and 77.3% showed a polymorphism. Cluster analysis revealed two major groups in Brazil. The observed genetic diversity (HE) was 0.22, and through molecular analysis of variance, it was determined that the greatest genetic variability occurs within populations. The Discriminant Analysis of Principal Components (DAPC) revealed no structuring related to the geographical origin of culture of the host. The IRAP-based marker system is a suitable tool for the study of genetic variability in P. fijiensis.
dc.format	application/pdf
dc.format	application/pdf
dc.language	eng
dc.publisher	Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher	BR
dc.publisher	Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse
dc.publisher	Mestrado em Microbiologia Agrícola
dc.publisher	UFV
dc.rights	Acesso Aberto
dc.subject	Black Sigatoka
dc.subject	Inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP)
dc.subject	Population genetics
dc.subject	Structure
dc.subject	Sigatoka Negra
dc.subject	Inter-retrotransposão polimorfismo amplificado (IRAP)
dc.subject	Genética de populações
dc.subject	Estrutura
dc.subject	CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE::MICROBIOLOGIA AGRICOLA
dc.title	Use of the IRAP marker to study genetic variability in Pseudocercospora fijiensis populations
dc.title	Use of the IRAP marker to study genetic variability in Pseudocercospora fijiensis populations
dc.type	Dissertação

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Universidade Federal de Viçosa (Brasil)