Accuracy of quantitative polymerase chain reaction in samples of frozen and paraffin-embedded healthy skin for the diagnosis of canine visceral leishmaniasis

Acurácia da reação em cadeia da polimerase quantitativa em amostras de pele íntegra congelada e parafinada no diagnóstico da leishmaniose visceral canina

dc.creatorCampos, M. P.
dc.creatorMadeira, Maria de Fátima
dc.creatorSilva, D. A.
dc.creatorSolcà, Manuela da Silva
dc.creatorEspíndola, O. M.
dc.creatorMendes Júnior, A. A. V.
dc.creatorFigueiredo, F. B.
dc.date2019-08-08T13:19:55Z
dc.date2019-08-08T13:19:55Z
dc.date2017
dc.date.accessioned2023-09-26T23:22:48Z
dc.date.available2023-09-26T23:22:48Z
dc.identifierCAMPOS, Maria de Fátima et al. Accuracy of quantitative polymerase chain reaction in samples of frozen and paraffin-embedded healthy skin for the diagnosis of canine visceral leishmaniasis. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 69, n. 6, p. 1443-1450, 2017.
dc.identifier0102-0935
dc.identifierhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34669
dc.identifier10.1590/1678-4162-9053
dc.identifier1678-4162
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8889935
dc.descriptionO objetivo deste trabalho foi avaliar a acurácia da PCR quantitativa (qPCR) realizada em amostras de pele íntegra congelada (FT) e parafinada (FFPE). Trata-se de um estudo de validação, com amostras provenientes de 46 cães de uma área endêmica no Brasil. Após as coletas de amostras, as extrações de DNA foram realizadas utilizando-se kits comerciais, e a qPCR foi orientada para alvos do kDNA da espécie Leishmania infantum. Os resultados obtidos para as amostras FFPE foram 63,6% de sensibilidade e 77,1% de especificidade; para as amostras FT, 100% e 48,6%, respectivamente. A concordância dos resultados da técnica de qPCR com amostras FT e FFPE foi pobre. Os resultados sugerem que o congelamento é o método mais adequado de conservação para banco de amostras para recuperação de DNA.
dc.descriptionThe purpose of the present work was to evaluate the accuracy of quantitative polymerase chain reaction (qPCR) performed on samples of fresh frozen tissue (FT) and formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) healthy skin. This is a validation study conducted with samples from 46 dogs from an endemic area in Brazil. After sample collection, DNA extractions were conducted using commercial kits and qPCR was oriented to kinetoplast DNA (kDNA) targets of the Leishmania infantum species. The results obtained for the FFPE samples showed 63.6% sensitivity and 77.1% specificity, whereas those obtained for the FT samples showed 100% and 48.6%, respectively. Poor agreement was observed for the results of the qPCR technique with FT and FFPE samples. Our results suggest freezing as the most suitable conservation method for the formation of sample databases considering DNA recovery.
dc.formatapplication/pdf
dc.languageeng
dc.publisherUniversidade Federal de Minas Gerais
dc.rightsopen access
dc.subjectDiagnosis
dc.subjectqPCR
dc.subjectCanine visceral leishmaniasis
dc.subjectDiagnóstico
dc.subjectqPCR
dc.subjectLeishmaniose visceral canina
dc.titleAccuracy of quantitative polymerase chain reaction in samples of frozen and paraffin-embedded healthy skin for the diagnosis of canine visceral leishmaniasis
dc.titleAcurácia da reação em cadeia da polimerase quantitativa em amostras de pele íntegra congelada e parafinada no diagnóstico da leishmaniose visceral canina
dc.typeArticle


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