Projeto e implementação de uma ferramenta para o escalonamento de processos e acesso aos dados biológicos
BioProvider implementation issues: a nonintrusive tool for process scheduling and biological data access
| dc.creator | Lifschitz, Sérgio | |
| dc.date | 2017-01-30T12:01:01Z | |
| dc.date | 2017-01-30T12:01:01Z | |
| dc.date | 2007 | |
| dc.date.accessioned | 2023-09-26T22:11:21Z | |
| dc.date.available | 2023-09-26T22:11:21Z | |
| dc.identifier | LIFSCHITZ, Sérgio. Projeto e implementação de uma ferramenta para o escalonamento de processos e acesso aos dados biológicos. RECIIS - Revista Eletrônica de Comunicação, Informação e Inovação em Saúde, Rio de Janeiro, v. 1, n. 2, p. Sup297-Sup303, 2007. | |
| dc.identifier | 1981-6278 | |
| dc.identifier | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/17602 | |
| dc.identifier | 10.3395/reciis.v1i2.Sup.99pt | |
| dc.identifier | 1981-6278 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8875983 | |
| dc.description | Este trabalho discute o projeto e implementação de uma ferramenta que provê dados voltados para programas de Bioinformática, denominada BioProvider. A ferramenta utiliza políticas ad-hoc de gerenciamento de buffer que lidam com dados de seqüências muito grandes e possibilita o controle do escalonamento de processos. Foi usada uma abordagem não intrusiva para viabilizar a utilização da ferramenta com os programas aplicativos de uso corrente pelos usuários. Neste trabalho, BioProvider foi instanciada para funcionar com o programa BLAST de comparações de seqüências. | |
| dc.description | This work discusses the implementation of BioProvider, a tool that efficiently provides data for biological applications. It uses ad-hoc buffer management policies and specific process scheduling control to deal with very large sequence data. We explain how to consider a non-intrusive approach in order to encourage the use of BioProvider in a transparent way while keeping the original applications unchanged. The first instantiation of BioProvider is tailored to BLAST, the most popular sequence comparison program. | |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | por | |
| dc.publisher | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Comunicação e Informação Cientifica e Tecnológica em Saúde. | |
| dc.rights | open access | |
| dc.subject | Escalonamento de Processos | |
| dc.subject | Dados Biológicos | |
| dc.subject | Bioinformática | |
| dc.subject | Bioprovider | |
| dc.subject | Process Scheduling | |
| dc.subject | Biological Data Access | |
| dc.subject | BioProvider | |
| dc.title | Projeto e implementação de uma ferramenta para o escalonamento de processos e acesso aos dados biológicos | |
| dc.title | BioProvider implementation issues: a nonintrusive tool for process scheduling and biological data access | |
| dc.type | Article |