| dc.contributor | Morgado, Mariza Gonçalves | |
| dc.contributor | Vicente, Ana Carolina Paulo | |
| dc.contributor | Bou-Habib, Dumith Chequer | |
| dc.contributor | Grassi, Maria Fernanda Rios | |
| dc.contributor | Gaspar, Ana Maria Coimbra | |
| dc.creator | Côrtes, Fernanda Heloise | |
| dc.date | 2013-09-17T12:30:56Z | |
| dc.date | 2013-09-17T12:30:56Z | |
| dc.date | 2010 | |
| dc.date.accessioned | 2023-09-26T22:07:40Z | |
| dc.date.available | 2023-09-26T22:07:40Z | |
| dc.identifier | CORTÊS, Fernanda Heloise. Avaliacao da antigenicidade de peptideos sinteticos correspondentes a regiao nef do HIV-1, obtidos a partir de sequencias consensos e de isolados dos subtipos B e F1. Rio de Janeiro, 2010. 93 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária) - Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2010. | |
| dc.identifier | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6913 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8875115 | |
| dc.description | Sequências virais centrais, incluindo consenso, ancestral e centro-da-árvore, vêm
sendo propostas para o desenho de potenciais imunógenos para o desenho de uma vacina
anti-HIV/Aids, por minimizarem a distância genética em relação aos vírus circulantes. No
Brasil a epidemia de Aids é causada primariamente pelo subtipo B, seguido dos subtipos
F1 e C, em adição a recombinantes B/F1 e B/C.
Este estudo teve como objetivo avaliar o uso potencial de sequências consenso
comparadas a sequências de isolados virais mais próximos, na definição de antígenos
vacinais. Bem como determinar o impacto do polimorfismo viral na resposta imune de
indivíduos infectados pelo HIV-1. Esta avaliação da resposta imune foi realizada com
células mononucleares do sangue periférico (CMSP) de indivíduos infectados pelo subtipo
B e F1, incluindo um grupo de controladores da carga viral e indivíduos não progressores
de longo termo, usando o ensaio de ELISpot IFN-γ.
Duas regiões em Nef (R1 e R3) apresentaram alta frequência de resposta, 84% e
73% para o pool de peptídeos referente ao consenso B e 65% e 69% para o consenso F1,
respectivamente. Em indivíduos infectados pelo subtipo B a frequência de resposta tanto
para o pool de peptídeos baseados na sequência do isolado quanto na sequência consenso
foi igual na R1 (93%) e muito próxima na região 2, 28% para o consenso contra 21% do
isolado. Na R3, as sequências do consenso e do isolado no subtipo B são idênticas, e 71%
dos indivíduos responderam ao pool dessa região. Nos indivíduos infectados pelo subtipo
F1 foram encontrados valores similares na frequência de resposta para a R1, 44% e 55%, e
idênticos na R3, 66%, para o consenso e o isolado, respectivamente. A magnitude de
resposta não foi significativamente diferente entre o consenso e isolado (P>0,05) para
ambas as regiões tanto para os indivíduos infectados pelo subtipo B quanto pelo F1.
Foi demonstrada uma forte reatividade cruzada frente aos peptídeos derivados dos
consensos dos subtipos B e F1 e do grupo M. Nos indivíduos infectados pelo subtipo B,
79% das respostas foram detectadas tanto com peptídeos do consenso B, como F1 e M, nos
indivíduos infectados pelo subtipo F1 essas respostas representaram 68%.
Juntos esses dados indicam que tanto a estratégia do consenso, quanto a do isolado
mais próximo é capaz de estimular uma resposta HIV específica. Além disso, nosso estudo
aponta que sequências referentes tanto ao subtipo B quanto ao F1 poderiam servir como
base para o desenho de imunógenos pautados na proteína Nef. | |
| dc.description | Centralized viral sequences, including consensus, ancestral and center-of-tree have
been proposed as potential immunogens for an anti-HIV/Aids vaccine design in order to
reduce the genetic distance from circulating viruses. In Brazil, Aids epidemic is primarily
caused by clade B, followed by clade F1 and C, with additional B/F and B/C recombinants.
The goal of this study was to evaluate the potential use of consensus sequences
compared with close viral isolate sequences in order to define vaccine antigens, as well as
to determine the impact of polymorphism on immune response from HIV-1 infected
subjects. Evaluation of the immune response was carried out with PBMCs from subjects
infected with clade B and F1, including a cohort of HIV viral load controllers and Long
Term Non Progressors, using an IFN-γ ELIspot assay.
Two regions in Nef (R1 and R3) demonstrated high frequency of response, 84%
and 73% for the pool of peptides based on consensus B, and 65% and 69% for consensus
F1, respectively. In clade B-infected subjects, the frequencies of response for both, pool of
peptides based on consensus and isolate sequence, were the same in R1 (93%) and very
close in R2, 28% to consensus and 21% to isolate. In R3, the sequences from consensus
and isolate were identical, and 71% of subjects responded to peptides in this region. In
clade F-infected subjects, the frequencies of responses were similar in R1, 44% and 55%,
and identical in R3, 66%, to consensus and isolate, respectively. No statistically significant
differences were observed for the magnitude of response between consensus and isolate
(P>0,05) for both regions in clade B- and F1-infected subjects.
Clade B- and F1-infected subjects were able to recognize peptides based on B-, F1-
and group M-consensus, showing a strong cross-clade response. In clade B-infected
subjects, 79% of positive response was detected both with consensus from clade B, F1 and
group M peptides. In clade F1-infected subjects this cross-clade response represented 68%.
Together, these data suggests that both, B and F1 consensus and their closest
isolates are able to detect similar HIV Nef specific responses. Our results show that
sequences based on clade B or F1 could equally serve for the design of immunogens
corresponding to the Nef protein. | |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | por | |
| dc.publisher | Instituto Oswaldo Cruz | |
| dc.rights | restricted access | |
| dc.subject | Avaliação da antigenicidade | |
| dc.subject | AIDS | |
| dc.subject | Infecção pelo HIV | |
| dc.subject | Diversidade Genética do HIV-1 | |
| dc.subject | Peptídeos sintéticos | |
| dc.title | Avaliação da antigenicidade de peptídeos sintéticos correspondentes a região nef do HIV-1, obtidos a partir de sequências consensos e de isolados dos subtipos B e F1 | |
| dc.type | Dissertation | |
