Diversidade de cepas de Stenotrophomonas maltophilia isoladas entre 1958 e 2021 e genotipadas por multilocus sequence typing

dc.creatorLage, Rebeca Vitória da Silva
dc.creatorCosta, Paula Vasconcelos
dc.creatorCosta, Luciana Veloso da
dc.creatorVasconcellos, Luiza
dc.creatorSilva, Samara Verley da
dc.creatorVillas-Bôas, Maria Helena Simões
dc.creatorBrandão, Marcelo Luiz Lima
dc.date2022-07-04T12:18:07Z
dc.date2022-07-04T12:18:07Z
dc.date2021
dc.date.accessioned2023-09-26T20:47:14Z
dc.date.available2023-09-26T20:47:14Z
dc.identifierLAGE, R. V. S. et al. Diversidade de cepas de Stenotrophomonas maltophilia isoladas entre 1958 e 2020 e genotipadas por Multilocus sequence typing. Revista Científica do UBM, Barra Mansa, v. 23, n. 45, p. 129-141, dez. 2021.
dc.identifier1516-4071
dc.identifierhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/53624
dc.identifier10.52397/rcubm.v23i45.1036
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8863879
dc.descriptionO objetivo deste estudo foi avaliar os dados in silico de cepas de S. maltophilia (n=974) caracterizadas por Multilocus Sequence Typing (MLST) disponíveis no banco PubMLST isoladas entre 1958 e 2020. As cepas com perfil alélico completo (n=972) foram analisadas utilizando a árvore filogenética neighbor-joining, a ferramenta minimum spanning tree e o algoritmo eBURST. O índice de Simpson foi aplicado para calcular o poder de resolução do MLST para tipificação. A maioria das cepas depositadas são de origem clínica (87,6%) e oriundas da Ásia (47,1%). As cepas de S. maltophilia apresentaram alta diversidade genética quando avaliadas, sendo identificadas em 679 ST distintos, uma taxa de ~1,4 cepa/ST. O índice de Simpson calculado foi de 0,99. O Brasil possui 10 cepas depositadas classificadas em sete ST distintos, sendo quatro isolados de infecções em humanos. Em conclusão, o MLST apresentou-se como uma ferramenta poderosa para investigações epidemiológicas de cepas de S. maltophilia.
dc.descriptionThe aim of this study was to evaluate in silico data from S. maltophilia strains (n=974) characterized by Multilocus Sequence Typing (MLST) available in the PubMLST database isolated between 1958 and 2020. Strains with full allelic profile in the database (n=972) were analyzed using neighbor-joining phylogenetic tree, the minimum spanning tree tool, and the eBURST algorithm. Simpson's index was applied to calculate the MLST resolving power for typing. The majority of strains deposited was from clinical origin (87.6%) and from Asia (47.1%). The S. maltophilia strains showed high genetic diversity when evaluated, being identified in 679 different ST, a ratio of ~1.4 strain/ST. The Simpson's index calculated was 0.99. The Brazil possess 10 strains deposited identified in seven different ST, being four isolated from human infections. In conclusion, the MLST seems to be a powerful tool for epidemiological investigations of S. maltophilia strains.
dc.descriptionEl propósito de este estudio fue evaluar datos in silico de cepas de S. maltophilia (n=974) caracterizadas por Multilocus Sequence Typing (MLST) disponibles en PubMLST aisladas entre 1958 y 2020. Cepas con perfil alélico completo (n=972) fueron analizadas utilizando el árbol filogenético neighbor-joining, la herramienta minimum spanning tree y el algoritmo eBURST. Se aplicó el índice de Simpson para calcular el poder de resolución MLST para la mecanografía. La mayoría de las cepas depositadas son de origen clínico (87,6%) y de Asia (47,1%). Las cepas de S. maltophilia mostraron una alta diversidad genética cuando se evaluaron, y se identificaron en 679 ST distintas, una tasa de ~ 1,4 cepa/ST. El índice de Simpson calculado fue 0,99. Brasil tiene 10 cepas depositadas, clasificadas en siete ST diferentes, cuatro de las cuales están aisladas de infecciones en humanos. En conclusión, el MLST se presentó como una poderosa herramienta para las investigaciones epidemiológicas de las cepas de S. maltophilia.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagepor
dc.rightsopen access
dc.subjectEpidemiologia
dc.subjectMLST
dc.subjectCaracterização molecular
dc.subjectStenotrophomonas maltophilia
dc.subjectEpidemiology
dc.subjectMLST
dc.subjectMolecular characterization
dc.subjectStenotrophomonas maltophilia
dc.subjectEpidemiología
dc.subjectMLST
dc.subjectCaracterización molecular
dc.subjectStenotrophomonas maltophilia
dc.subjectEpidemiologia
dc.subjectHomólogo LST8 da Proteína Associada a MTOR
dc.subjectStenotrophomonas maltophilia
dc.titleDiversidade de cepas de Stenotrophomonas maltophilia isoladas entre 1958 e 2021 e genotipadas por multilocus sequence typing
dc.typeArticle


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