Optimization of randomly amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction for molecular typing of Salmonella enterica serovar Typhi

Otimização da reação de amplificação aleatória do DNA polimórfico – reação em cadeia da polimerase para tipagem molecular de Salmonella enterica sorovar Typhi

dc.creatorQuintaes, Bianca Ramalho
dc.creatorLeal, Nilma Cintra
dc.creatorReis, Eliane Moura Falavina dos
dc.creatorHofer, Ernesto
dc.date2019-11-14T15:25:22Z
dc.date2019-11-14T15:25:22Z
dc.date2004
dc.date.accessioned2023-09-26T20:30:13Z
dc.date.available2023-09-26T20:30:13Z
dc.identifierQUINTAES, Bianca Ramalho et al. Optimization of randomly amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction for molecular typing of Salmonella enterica serovar Typhi. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, Uberaba, v. 37, n. 2, p. 143-147, mar./abr. 2004.
dc.identifier0037-8682
dc.identifierhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/37072
dc.identifier10.1590/S0037-86822004000200006
dc.identifier1678-9849
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8858324
dc.descriptionA otimização da reação de RAPD para a caracterização de cepas de Salmonella enterica sorovar Typhi foi estudada com o objetivo de assegurar a reprodutibilidade e o poder discriminatório desta técnica. Oito cepas de Salmonella sorovar Typhi isoladas de algumas regiões do Brasil foram usadas para examinar os padrões de fragmentação produzidos quando foram empregadas concentrações diferentes do DNA molde, do iniciador, do MgCl2 e da enzima Taq DNA polimerase. Com a utilização de dois diferentes perfis de ciclos termais de baixa estringência, foram comparados os padrões de bandeamento obtidos. Um conjunto de dezesseis iniciadores foi avaliado quanto à capacidade de produzir elevado número de fragmentos distintos. Observou-se que variações associadas a todos os parâmetros testados modificaram os padrões de bandeamento. Para as amostras de Salmonella enterica sorovar Typhi utilizadas neste experimento, definiu-se um conjunto de condições para a reação de RAPD-PCR que resultou num método de tipagem simples, rápido e reprodutível.
dc.descriptionOptimization of the RAPD reaction for characterizing Salmonella enterica serovar Typhi strains was studied in order to ensure the reproducibility and the discriminatory power of this technique. Eight Salmonella serovar Typhi strains isolated from various regions in Brazil were examined for the fragment patterns produced using different concentrations of DNA template, primer, MgCl2 and Taq DNA polymerase. Using two different low stringency thermal cycle profiles, the RAPD fingerprints obtained were compared. A set of sixteen primers was evaluated for their ability to produce a high number of distinct fragments. We found that variations associated to all of the tested parameters modified the fingerprinting patterns. For the strains of Salmonella enterica serovar Typhi used in this experiment, we have defined a set of conditions for RAPD-PCR reaction, which result in a simple, fast and reproducible typing method.
dc.formatapplication/pdf
dc.languageeng
dc.publisherSociedade Brasileira de Medicina Tropical
dc.rightsopen access
dc.subjectOtimização
dc.subjectRAPD
dc.subjectReação em Cadeia da Polimerase
dc.subjectSalmonella enterica serovar Typhi
dc.subjectBrasil
dc.subjectOptimization
dc.subjectSalmonella enterica serovar Typhi
dc.subjectRAPD
dc.subjectPCR
dc.subjectBrazil
dc.titleOptimization of randomly amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction for molecular typing of Salmonella enterica serovar Typhi
dc.titleOtimização da reação de amplificação aleatória do DNA polimórfico – reação em cadeia da polimerase para tipagem molecular de Salmonella enterica sorovar Typhi
dc.typeArticle


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