Seqüenciamento parcial do DNA mitocondrial de Biomphalaria straminea e análise comparativa com Biomphalaria glabrata e Biomphalaria tenagophila

Partial sequencing of the mitochondrial DNA of Biomphalaria straminea and comparative analysis with Biomphalaria glabrata and Biomphalaria tenagophila

dc.contributorCaldeira, Roberta Lima
dc.contributorPassos, Liana Konovallof Jannotti
dc.contributorCaldeira, Roberta Lima
dc.contributorDrumond, Betania Paiva
dc.contributorSouza, Raquel Lopes Martins
dc.creatorGoveia, Christiane Oliveira
dc.date2019-07-31T14:03:54Z
dc.date2019-07-31T14:03:54Z
dc.date2010
dc.date.accessioned2023-09-26T20:08:17Z
dc.date.available2023-09-26T20:08:17Z
dc.identifierGOVEIA, Christiane Oliveira. Seqüenciamento parcial do DNA mitocondrial de Biomphalaria straminea e análise comparativa com Biomphalaria glabrata e Biomphalaria tenagophila. 2010. 78 f. Dissertação (Mestrado em Ciências)-Centro de Pesquisas René Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte, 2010.
dc.identifierhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/34531
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8849442
dc.descriptionNo Brasil, existem três espécies hospedeiras intermediárias do Schistosoma mansoni: Biomphalaria glabrata, B. tenagophila e B. straminea. Em virtude da importância epidemiológica dessas espécies, técnicas moleculares vêm sendo introduzidas no estudo destes moluscos. Com o desenvolvimento da técnica de sequenciamento automático de nucleotídeos, tornou-se possível aumentar consideravelmente as informações sobre o genoma de diversos organismos, inclusive sobre o DNA mitocondrial de moluscos, no qual os estudos vêm crescendo nos últimos anos. Das espécies do gênero Biomphalaria, B. glabrata e B. tenagophila têm o seu genoma mitocondrial totalmente sequenciado. Neste trabalho foi parcialmente sequenciado e caracterizado o DNAmt de B. straminea e comparado aos de B. glabrata e B. tenagophila. Para sequenciar o DNAmt de B. straminea, foi extraído o DNA total da região cefalopodal do molusco. Inicialmente as regiões 16S, citocromo c oxidase subunidade I (COI), 12S, citocromo c oxidase subunidade III (COIII) e ND1 foram parcialmente amplificadas e sequenciadas. A partir das sequências obtidas, iniciadores específicos foram desenhados para amplificar quatro fragmentos maiores do DNA mitocondrial de B. straminea: 12SCOIII, COIII-COI, COI-16S e 16S-ND1, que foram clonados e sequenciados. Para a amplificação desses fragmentos foram utilizados iniciadores direcionados para a técnica de PCR longo e em seguida desenhados iniciadores internos (primer walking). Foram sequenciados 7.764 nucleotídeos, totalizando 2.588 aminoácidos, relativos aos genes: COI, COIII, ND1 (parcial), ND2, ND3, ND4, ND5 e ND6. Foi realizada a comparação das sequências dos aminoácidos, dos códons de iniciação e de parada entre B. straminea, B. tenagophila e B. glabrata, sendo encontradas diferenças no tamanho e na composição dos genes. A ordem dos genes de B. straminea foi a mesma que a de B. tenagophila e B. glabrata. A sequência nucleotídica do gene COI foi analisada devido ao seu potencial na separação de espécies, baseada na abordagem de código de barra de DNA (DNA Barcode). Esta análise permitiu distinguir B. straminea das outras duas espécies transmissoras da esquistossomose no Brasil.
dc.descriptionIn Brazil, there are three intermediate host species of Schistosoma mansoni: Biomphalaria glabrata, B. tenagophila and B. straminea. Due to the epidemiologic relevance of these species, molecular techniques have been introduced in the study of these molluscs. The development of the technique for automatic sequencing of nucleotides has enabled a considerable increase of information about the genome of several organisms, including the mitochondrial DNA of molluscs whose studies have been increasing in recent years. The B. glabrata and B. tenagophila species present totally sequenced mitochondrial genomes. In this work, the mtDNA of B. straminea was partially sequenced and compared to those of B. glabrata and B. tenagophila. In order to sequence the mtDNA for B. straminea, the total DNA was extracted from cephalopodal region of the mollusc. The regions of 16S, cytochrome c oxidase subunit I (COI), 12S, cytochrome c oxidase sub-unit III (COIII) and ND1 were partially amplified and sequenced. The obtained sequences enabled the drawing of specific primers for amplification of four larger mitochondrial DNA fragments of B. straminea: 12S-COIII, COIII-COI, COI-16S and 16S-ND1, which were cloned and sequenced. For the amplification of these fragments, there were utilized primers directed to the long PCR technique and drawing of primer walking. There were sequenced 7,764 nucleotides, with a total of 2,588 amino acids related to genes COI, COIII, ND1 (partial), ND2, ND3, ND4, ND5 and ND6. There were comparisons of amino acid sequences, start and stop between B. straminea, B. tenagophila and B. glabrata, with differences in gene size and composition. The B. straminea gene order was identical to B. tenagophila e B. glabrata. The nucleotide sequence of the COI gene was analyzed due to its potential in species separation, based on the DNA Barcode approach. This analysis enabled the differentiation from B. straminea from other two species that transmit schistosomiasis in Brazil.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagepor
dc.rightsopen access
dc.subjectEsquistossomose mansoni
dc.subjectBiomphalaria
dc.subjectDNA Mitocondrial
dc.subjectEsquistossomose mansoni
dc.subjectSchistosoma mansoni
dc.subjectBiomphalaria
dc.subjectDNA Mitocondrial
dc.titleSeqüenciamento parcial do DNA mitocondrial de Biomphalaria straminea e análise comparativa com Biomphalaria glabrata e Biomphalaria tenagophila
dc.titlePartial sequencing of the mitochondrial DNA of Biomphalaria straminea and comparative analysis with Biomphalaria glabrata and Biomphalaria tenagophila
dc.typeDissertation


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