dc.contributorLeón Ramos, Cielo Maritza
dc.contributorGonzález Rosas, Camila
dc.contributorCentro de investigación en microbiología y parasitología tropical (CIMPAT)
dc.creatorBolívar Flórez, Juliana Valentina
dc.date.accessioned2023-07-27T15:14:10Z
dc.date.accessioned2023-09-07T00:44:08Z
dc.date.available2023-07-27T15:14:10Z
dc.date.available2023-09-07T00:44:08Z
dc.date.created2023-07-27T15:14:10Z
dc.date.issued2023-06-21
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/1992/68832
dc.identifierinstname:Universidad de los Andes
dc.identifierreponame:Repositorio Institucional Séneca
dc.identifierrepourl:https://repositorio.uniandes.edu.co/
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8727708
dc.description.abstractEl virus del Chikungunya (CHIKV) es un alfavirus transmitido por los mosquitos Aedes aegypti y Aedes albopictus (Higgs et al., 2015). Este virus representa un problema en salud pública, ya que en la actualidad se está diseminando en áreas urbanas (Carbona et al., 2018). Durante el transcurso del año 2022 se reportaron un total de 271.176 casos de chikunguña en la región de las Américas, lo que supone un número mayor de casos reportados que en años anteriores (OMS, 2023). El objetivo de este trabajo fue realizar la estandarización de un método de detección rápido, sensible y de bajo costo llamado amplificación isotérmica mediada por bucle con transcripción inversa (RT-LAMP), implementado el uso de un dispositivo portátil de bajo costo (Portable Low-cost User-friendly Multimode PLUM) para la interpretación de los resultados. Para llevar a cabo la estandarización, se realizaron diluciones seriadas para evaluar el desempeño analítico de la técnica RT-PCR convencional y de la RT-LAMP, determinando el Rango reportable anticipado (RRA) y el Límite de detección (LoD). Se encontró que el LoD para la RT-LAMP se ajusta a la dilución 1/10^6, en comparación con la RT-PCR convencional donde el LoD corresponde a la dilución 1/10^3. En conclusión, se logró estandarizar por primera vez la técnica RT-LAMP con el uso del PLUM, donde la RT-LAMP mostró en comparación con la técnica RT-PCR convencional una mayor sensibilidad, debido a que detecta menores concentraciones del CHIKV.
dc.languagespa
dc.publisherUniversidad de los Andes
dc.publisherMicrobiología
dc.publisherFacultad de Ciencias
dc.publisherDepartamento de Ciencias Biológicas
dc.relationEscalante-Maldonado, O., Gavilán, R. G., García, M. P., Marcelo, A., Pacheco, E., Cabezas, C., & Yamazaki, W. (2019). Desarrollo y validación del método de amplificación isotérmica mediada en lazo para la detección del virus Zika. Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud Publica, 36, 442-447.
dc.relationLira Carmona, R., De la Cruz Pérez, J., Maldonado Rodríguez, A., & Rojas Montes, O. (2018). Sistemas de amplificación isotérmica para la detección molecular de los virus zika, dengue y chikungunya. Mens. Bioquim, 42, 92-102.
dc.relationNotomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., & Hase, T. (2000). Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic acids research, 28(12), e63-e63.
dc.relationPalacios-Martínez, D., Díaz-Alonso, R. A., Arce-Segura, L. J., & Díaz-Vera, E. (2015). Chikungunya, una enfermedad vírica emergente. Propuesta de un algoritmo de manejo clínico. SEMERGEN-Medicina de Familia, 41(4), 221-225.
dc.relationYaren, O., Alto, B. W., Bradley, K. M., Moussatche, P., Glushakova, L., & Benner, S. A. (2018). Multiplexed isothermal amplification based diagnostic platform to detect zika, chikungunya, and dengue 1. JoVE (Journal of Visualized Experiments), (133), e57051
dc.relationHiggs S, Vanlandingham D 2015. Chikungunya virus and its mosquito vectors. Vector Borne Zoonotic Dis 15:231-240.
dc.relationSam I, Kummerer B, Chan Y, Roques P, Drosten C, Abubakar S 2015. Updates on Chikungunya epidemiology, Clinical disease, and Diagnostics. Vector-Borne Zoo Dis 5;(4):223-230
dc.relationSreekumar, E., Issac, A., Nair, S., Hariharan, R., Janki, M. B., Arathy, D. S., ... & Pillai, M. R. (2010). Genetic characterization of 2006-2008 isolates of Chikungunya virus from Kerala, South India, by whole genome sequence analysis. Virus genes, 40, 14-27.
dc.relationZuluaga-Gómez M, Vanegas Isaza D. El virus Chikungunya en Colombia: aspectos clínicos y epidemiológicos y revisión de la literatura. Iatreia [Internet]. 17 de noviembre de 2015 [citado 14 de julio de 2023];29(1):65-74. Disponible en: https://revistas.udea.edu.co/index.php/iatreia/article/view/21728
dc.relationKaur, P., & Chu, J. J. H. (2013). Chikungunya virus: an update on antiviral development and challenges. Drug discovery today, 18(19-20), 969-983.
dc.relationBarton, D. J., Sawicki, S. G., & Sawicki, D. L. (1991). Solubilization and immunoprecipitation of alphavirus replication complexes. Journal of virology, 65(3), 1496-1506.
dc.relationEkström, M., Liljeström, P., & Garoff, H. (1994). Membrane protein lateral interactions control Semliki Forest virus budding. The EMBO Journal, 13(5), 1058-1064.
dc.relationRougeron, V., Sam, I. C., Caron, M., Nkoghe, D., Leroy, E., & Roques, P. (2015). Chikungunya, a paradigm of neglected tropical disease that emerged to be a new health global risk. Journal of clinical Virology, 64, 144-152.
dc.relationNotomi, T., Mori, Y., Tomita, N., & Kanda, H. (2015). Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): principle, features, and future prospects. Journal of microbiology, 53(1), 1-5
dc.relationArroyo, M. I., Morales, G. P., Sosa, P. A., Carmona-Fonseca, J., & Maestre, A. (2008). Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica.
dc.relationEpidemiológica, P. A. Aumento de casos y defunciones por chikunguña en la Región de las Américas. 2023. Descarga: https://www. paho. org/es/documentos/alerta-epidemiologica-aumento-chikunguna-region-americas.
dc.relationOrganización Panamericana de la Salud / Organización Mundial de la Salud. Alerta Epidemiológica: Aumento de casos y defunciones por chikunguña en la Región de las Américas. 8 de marzo de 2023. Washington, D.C. OPS/OMS. 2023
dc.relationda Silva, S. J. R., Pardee, K., Balasuriya, U. B., & Pena, L. (2021). Development and validation of a one-step reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) for rapid detection of ZIKV in patient samples from Brazil. Scientific reports, 11(1), 4111.
dc.relationSaechue, B., Kamiyama, N., Wang, Y., Fukuda, C., Watanabe, K., Soga, Y., ... & Kobayashi, T. (2020). Development of a portable reverse transcription loop-mediated isothermal amplification system to detect the E1 region of Chikungunya virus in a cost-effective manner. Genes to Cells, 25(9), 615-625.
dc.relationLeón, C. M., Muñoz, M., Hernández, C., Ayala, M. S., Flórez, C., Teherán, A., ... & Ramírez, J. D. (2017). Analytical performance of four polymerase chain reaction (PCR) and real time PCR (qPCR) assays for the detection of six Leishmania species DNA in Colombia. Frontiers in microbiology, 8, 1907.
dc.relationParida MM, Santhosh SR, Dash PK, Tripathi NK, Lakshmi V, Mamidi N, Shrivastva A, Gupta N, Saxena P, Babu JP, Rao PV, Morita K. Rapid and real-time detection of Chikungunya virus by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assay. J Clin Microbiol. 2007 Feb;45(2):351-7. doi: 10.1128/JCM.01734-06. Epub 2006 Nov 29. PMID: 17135444; PMCID: PMC1829040.
dc.relationLow-cost Platform for Virus Detection PLUM-HTTM for RT-LAMP and ELISA. (n.d.). Plum: Low-cost plate reader for Elisa and lamp tests. LSK Technologies. https://www.lifesci-key.com/virus-detection-for-laboratory/p/low-cost-plate-reader
dc.rightsAttribution-NoDerivatives 4.0 Internacional
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nd/4.0/
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.titleEstandarización de la prueba RT-LAMP para la detección del virus del Chikungunya
dc.typeTrabajo de grado - Pregrado


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