Evaluación de la Eficiencia de Muestras de Saliva para el Diagnóstico Molecular de SARS-COV-2 Frente a Hisopado Nasofaríngeo en Población Adulta de la Ciudad de Cúcuta, 2021-2022

Abstract

La enfermedad del coronavirus es una enfermedad respiratoria que surgió en el 2019 y que hasta el día de hoy permanece y se extiende por varios países del mundo. Debido a esta problemática sanitaria ocurrieron una serie de problemas de escasez de recursos médicos, el carácter invasivo y el riesgo de infección que conlleva la recogida de muestras de hisopo nasofaríngeo hace que se requieran alternativas menos invasivas, eficaces y sensibles para la detección del ARN del SARS-CoV-2, además que sea posible la detección del virus en zonas donde los casos son elevados y obtener suministros médicos es difícil, al igual que la recolección de la muestra por la complejidad del transporte del hisopado nasofaríngeo. La muestra de saliva puede ser recogida por los propios pacientes, lo que ayudaría a superar la escasez de equipos de protección personal y herramientas de toma de muestras. Por lo que en este proyecto de investigación se buscó la idoneidad de la saliva como muestra obtenida de forma no invasiva para la detección molecular del SARS-CoV-2 con COVID-19 en población adulta sintomáticos y asintomáticos de la Ciudad de Cúcuta. De 105 pacientes, se recolectaron 210 muestras, 105 de saliva y 105 de hisopado, los resultados positivo y negativo de cada prueba se replicaron en cada paciente, lo que evidenció una fuerza de concordancia muy buena y una alta sensibilidad con un valor máximo del 100%, al igual para valor predictivo positivo y negativo. Por último, kappa de Cohen de K 1,0, con error estándar de 0,0. En conclusión, los resultados del estudio sugieren a la saliva como potencial alternativa a los hisopados nasofaríngeos como muestra altamente sensible, menos invasiva, segura y de fácil obtención para la RT-PCR del SARS-CoV-2.

Coronavirus disease is a respiratory disease that emerged in 2019 and to this day remains and spreads in several countries around the world. Due to this health issue occurred a series of problems of shortage of medical resources, the invasive nature and risk of infection involved in the collection of nasopharyngeal swab samples makes less invasive, effective and sensitive alternatives are required for the detection of SARS-CoV-2 RNA, also that it is possible to detect the virus in areas where cases are high and obtaining medical supplies is difficult, as is the collection of the sample due to the complexity of transporting the nasopharyngeal swab. The saliva sample can be collected by the patients themselves, which would help overcome the shortage of personal protective equipment and sampling tools. Therefore, this research project sought the suitability of saliva as a sample obtained noninvasively for the molecular detection of SARS-CoV-2 with COVID-19 in symptomatic and asymptomatic adult population in the city of Cúcuta. Of 105 patients, 210 samples were collected, 105 saliva and 105 swab samples, the positive and negative results of each test were replicated in each patient, which evidenced a very good concordance strength and a high sensitivity with a maximum value of 100%, as well as for positive and negative predictive value. Finally, Cohen's kappa of K 1.0, with standard error of 0.0. In conclusion, the results of the study suggest saliva as a potential alternative to nasopharyngeal swabs as a highly sensitive, less invasive, safe and easily obtained sample for SARS-CoV-2 RT-PCR.