| dc.contributor | Artoni, Roberto Ferreira | |
| dc.contributor | 13854979800 | |
| dc.contributor | http://lattes.cnpq.br/8875928930712027 | |
| dc.contributor | Almeida, Mara Cristina de | |
| dc.contributor | 123.420.298-02 | |
| dc.contributor | http://lattes.cnpq.br/8595585057634471 | |
| dc.contributor | Matoso, Daniele Aparecida | |
| dc.contributor | 025. 234.339 58 | |
| dc.contributor | http://lattes.cnpq.br/5146110299023355 | |
| dc.contributor | Universidade Estadual de Ponta Grossa (UEPG) | |
| dc.contributor | Universidade Federal do Amazonas | |
| dc.creator | Oliveira, Juliane Vida Lemos de | |
| dc.date | 2022-12-08T23:25:06Z | |
| dc.date | 2022-12-08 | |
| dc.date | 2022-12-08T23:25:06Z | |
| dc.date | 2022-08-26 | |
| dc.date.accessioned | 2023-08-31T23:35:44Z | |
| dc.date.available | 2023-08-31T23:35:44Z | |
| dc.identifier | OLIVEIRA, Juliane Vida Lemos de. Descrição de uma variante cariotípica e caracterização do mitogenoma e satelitoma de Rineloricaria lanceolata (Siluriformes, Loricaridae). 2022. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Ponta Grossa, Ponta Grossa. 2022. | |
| dc.identifier | http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/3804 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8568677 | |
| dc.description | Among the Neotropical fishes, the genus Rineloricaria is characterized by a great
karyotypic diversity. These are fishes popularly known as armored catfish. Cytogenetic
data for the genus show an evident polymorphism in these species, with different
diploid numbers and karyotypic formulas, which may have their origin from
chromosomal rearrangements, such as fissions, fusions, or translocations. In this
sense, advances in genome sequencing technologies and bioinformatics have
provided tools and approaches for genetic studies in these organisms. In this
dissertation, we explore data obtained from Next-Generation Sequencing (NGS) of
Rineloricaria lanceolata and use a series of bioinformatics tools. With this, we aimed
to highlight karyotypic polymorphism in Rineloricaria lanceolata and explore the data
obtained by sequencing the genome of the species, with the intention of raising
hypotheses about the emergence of karyotypic variation in the group. The partial
mitogenome was obtained and functional annotation performed, and it was possible to
establish the first partial mitogenome described for the genus Rineloricaria. The
satellitome of R. lanceolata showed 40 sequences of repetitive DNAs for the species
classified in different families. With the discovery of the sequences, we suggest the
confection of cytogenetic markers for the most abundant sequences in the genome of
the species. Cytogenetic characterization of the sample from a population of R.
lanceolata also revealed significant differences in the karyotypes, such as a new
variant not yet observed for the species. Finally, we conclude that in silico approaches
are an important complement to future in situ techniques such as FISH, and are
essential to answer possible questions surrounding the species. Therefore, the current
work is a starting point for new karyo-evolutionary approaches involving the genus. | |
| dc.description | Dentre os peixes neotropicais, o gênero Rineloricaria é caracterizado por possuir uma
grande diversidade cariotípica. São peixes popularmente conhecidos como bagres
blindados. Os dados citogenéticos para o gênero mostram um polimorfismo evidente
nessas espécies, com diferentes números diploides e fórmulas cariotípicas, que podem
ter a sua origem a partir de rearranjos cromossômicos, como fissões, fussões ou
translocações. Neste sentido, os avanços das tecnologias de sequenciamento de
genomas e a bioinformática, tem fornecido ferramentas e abordagens para estudos
genéticos nesses organismos. Nessa dissertação, exploramos dados obtidos do
sequenciamento de Nova Geração (NGS) de Rineloricaria lanceolata e utilizamos uma
série de ferramentas de bioinformática. Com isso, objetivamos evidenciar o polimorfismo
cariotípico em Rineloricaria lanceolata e explorar os dados obtidos pelo sequenciamento
do genoma da espécie, na intenção de levantar hipóteses sobre o surgimento da
variação cariotípica no grupo. O mitogenoma parcial foi obtido e a anotação funcional
realizada, sendo possível estabelecer o primeiro mitogenoma parcial descrito para o
gênero Rineloricaria. O satelitoma de R. lanceolata evidenciou 40 sequências de DNAs
repetitivos para a espécie classificadas em diferentes famílias. Com a descoberta das
sequências, sugerimos a confecção de marcadores citogenéticos para as sequências
mais abundantes no genoma da espécie. A caracterização citogenética da amostra de
uma população de R. lanceolata também revelou diferenças significativas nos cariótipos,
como uma nova variante ainda não observada para a espécie. Por fim, concluímos que
abordagens in silico é um importante complemento para futuras técnicas in situ como
FISH, sendo essenciais para responder possíveis questões que cercam a espécie.
Portanto, o trabalho atual é um ponto de partida para novas abordagens cario-evolutivas
envolvendo o gênero. | |
| dc.language | por | |
| dc.publisher | Universidade Estadual de Ponta Grossa | |
| dc.publisher | Brasil | |
| dc.publisher | Setor de Ciências Biológicas e da Saúde | |
| dc.publisher | Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas | |
| dc.publisher | UEPG | |
| dc.rights | Acesso Aberto | |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil | |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | |
| dc.subject | Rineloricaria | |
| dc.subject | Satelitoma | |
| dc.subject | Mitogenoma | |
| dc.subject | Polimorfismo | |
| dc.subject | Rineloricaria | |
| dc.subject | Satellitetome | |
| dc.subject | Mitogenome | |
| dc.subject | Polymorphism | |
| dc.subject | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS | |
| dc.title | Descrição de uma nova variante cariotípica e caracterização do mitogenoma e satelitoma de Rineloricaria lanceolata (Siluriformes, Loricaridae) | |
| dc.type | Dissertação | |
