Genome sequence analysis of Pseudomonas extremaustralis provides new insights into environmental adaptability and extreme conditions resistance

dc.creatorRaiger Iustman, Laura Judith
dc.creatorTribelli, Paula Maria
dc.creatorIbarra, José Gervasio
dc.creatorCatone, Mariela Verónica
dc.creatorSolar Venero, Esmeralda Clara
dc.creatorLópez, Nancy Irene
dc.date2015-01
dc.date.accessioned2023-08-31T00:20:17Z
dc.date.available2023-08-31T00:20:17Z
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11336/182028
dc.identifierRaiger Iustman, Laura Judith; Tribelli, Paula Maria; Ibarra, José Gervasio; Catone, Mariela Verónica; Solar Venero, Esmeralda Clara; et al.; Genome sequence analysis of Pseudomonas extremaustralis provides new insights into environmental adaptability and extreme conditions resistance; Springer Tokyo; Extremophiles; 19; 1; 1-2015; 207-220
dc.identifier1431-0651
dc.identifier1433-4909
dc.identifierCONICET Digital
dc.identifierCONICET
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/8543328
dc.descriptionThe genome of the Antarctic bacterium Pseudomonas extremaustralis was analyzed searching for genes involved in environmental adaptability focusing on anaerobic metabolism, osmoregulation, cold adaptation, exopolysaccharide production and degradation of complex compounds. Experimental evidences demonstrated the functionality of several of these pathways, including arginine and pyruvate fermentation, alginate production and growth under cold conditions. Phylogenetic analysis along with genomic island prediction allowed the detection of genes with probable foreign origin such as those coding for acetate kinase, osmotic resistance and colanic acid biosynthesis. These findings suggest that in P. extremaustralis the horizontal transfer events and/or gene redundancy could play a key role in the survival under unfavorable conditions. Comparative genome analysis of these traits in other representative Pseudomonas species highlighted several similarities and differences with this extremophile bacterium.
dc.descriptionFil: Raiger Iustman, Laura Judith. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.descriptionFil: Tribelli, Paula Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.descriptionFil: Ibarra, José Gervasio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.descriptionFil: Catone, Mariela Verónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.descriptionFil: Solar Venero, Esmeralda Clara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.descriptionFil: López, Nancy Irene. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.formatapplication/pdf
dc.languageeng
dc.publisherSpringer Tokyo
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://link.springer.com/article/10.1007/s00792-014-0700-7
dc.relationinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00792-014-0700-7
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subjectENVIRONMENTAL ADAPTABILITY
dc.subjectEXOPOLYSACCHARIDES
dc.subjectGENOME ANALYSIS
dc.subjectHORIZONTAL TRANSFER
dc.subjectMICROAEROBIC METABOLISM
dc.subjectPSEUDOMONAS
dc.subjecthttps://purl.org/becyt/ford/1.6
dc.subjecthttps://purl.org/becyt/ford/1
dc.titleGenome sequence analysis of Pseudomonas extremaustralis provides new insights into environmental adaptability and extreme conditions resistance
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion


Este ítem pertenece a la siguiente institución