Caracterização de rizóbios indicados para produção de inoculantes por meio de sequenciamento parcial do 16S rRNA

dc.contributorUniversidade Estadual Paulista (UNESP)
dc.creatorToledo, Bethânia Figueiredo Barbosa de
dc.creatorMarcondes, Jackson
dc.creatorLemos, Eliana Gertrudes de Macedo
dc.date2014-05-20T13:17:50Z
dc.date2014-05-20T13:17:50Z
dc.date2009-04-01
dc.date.accessioned2017-04-05T19:39:14Z
dc.date.available2017-04-05T19:39:14Z
dc.identifierPesquisa Agropecuária Brasileira. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Informação TecnológicaPesquisa Agropecuária Brasileira, v. 44, n. 4, p. 384-391, 2009.
dc.identifier0100-204X
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/11449/4146
dc.identifier10.1590/S0100-204X2009000400008
dc.identifierS0100-204X2009000400008
dc.identifierWOS:000267704400008
dc.identifierS0100-204X2009000400008.pdf
dc.identifierhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2009000400008
dc.identifier.urihttp://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/853536
dc.descriptionO objetivo deste trabalho foi confrontar as sequências parciais do gene 16S rRNA de estirpes padrão de rizóbios com as de estirpes recomendadas para a produção de inoculantes no Brasil, com vistas à verificação da confiabilidade do sequenciamento parcial desse gene para a identificação rápida de estirpes. Foram realizados sequenciamentos através de reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rRNA entre as bactérias estudadas. Os resultados foram analisados pela consulta de similaridade de nucleotídeos aos do Basic Local Alignment Search Tool (Blastn) e por meio da interpretação de árvores filogenéticas geradas usando ferramentas de bioinformática. A classificação taxonômica das estirpes Semia recomendadas para inoculação de leguminosas com base em propriedades morfológicas e especificidade hospedeira não foi confirmada em todas as estirpes. A maioria das estirpes estudadas, consultadas no Blastn, é consistente com a classificação proposta pela construção de árvores filogenéticas das sequências destas estirpes, com base na similaridade pelo sequenciamento parcial do gene considerado.
dc.descriptionThe aim of this work was to compare the partial sequences of 16S rRNA gene of rhizobia strain patterns already classified with strains recommended for the production of inoculants in Brazil, in order to verify the reliability of partial sequencing of the gene for the purpose of rapid identification of strains. Polymerase Chain Reaction (PCR) sequencing using primers on the coding region of the 16S rRNA gene among the bacteria studied was conducted. The results were analyzed by consulting the nucleotides' similarity based on Basic Local Alignment Search Tool (Blastn) and by interpreting the phylogenetic trees generated by bioinformatic tools. The taxonomic classification of Semia strains recommended for legume inoculation based on morphological properties and host specificity was not confirmed in all strains. The similarity of the Blastn consultation by partial sequencing of the gene found in strains studied is consistent with the classification proposed by the construction of a phylogenetic tree of sequences of strains in most cases.
dc.languagepor
dc.publisherEmpresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)
dc.relationPesquisa Agropecuária Brasileira
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectBradyrhizobium
dc.subjectRhizobium
dc.subjectPhylogeny
dc.subjectBradyrhizobium
dc.subjectRhizobium
dc.subjectFilogenia
dc.titleCaracterização de rizóbios indicados para produção de inoculantes por meio de sequenciamento parcial do 16S rRNA
dc.typeOtro


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