Molecular identification of Fusarium isolates associated with passion fruit in five locations from Valle del Cauca, Colombia.

Identificación molecular de aislamientos de Fusarium asociados a maracuyá en el Valle del Cauca, Colombia

dc.creatorHenao-Henao, Edwin David
dc.creatorHernandez-Medina, Carlos Alberto
dc.creatorSalazar-González, Claudia
dc.creatorVelasco-Belalcazar, Martha Lucia
dc.creatorGómez-López, Eyder Daniel
dc.date2018-01-01
dc.date.accessioned2023-08-03T18:55:59Z
dc.date.available2023-08-03T18:55:59Z
dc.identifierhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114
dc.identifier10.15517/ma.v29i1.27114
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/7904012
dc.descriptionThe passion fruit’s production in Colombia has shown great advances; however, phytosanitary diseases remain as issues in passion fruit production. This includes the pathogens that hinder the establishment and development of the crop, such as some species of the genus Fusarium, pathogen considered as an important one because of the economic losses that it generates. The objective of this work was to molecularly identificate the populations of Fusarium associated with passion fruit (Passiflora edulis). Between January and December 2015, an isolation of 35 samples based on different affected organs of the plant and from localities found in five municipalities was performed in Valle del Cauca, Colombia. Eight isolates were selected and purified in order to perform their DNA’s extraction and also an amplification of region TEF 1 alpha. The PCR products were sequenced and compared with the NCBI database and Fusarium ID. The results obtained by sequencing showed that the isolates belong to Fusarium incarnatum, Fusarium solani, and Fusarium proliferatum, the first species had a mayor occurrence in the tested samples. The analysis of phylogenetic relationships was achieved by using the 6 MEGA program, and by using the similarity coefficient nearest neighbor, which allowed to observe the variability among the evaluated isolates.en-US
dc.descriptionLa producción de maracuyá en Colombia ha mostrado grandes avances; sin embargo, las enfermedades continúan siendo un factor limitante en la producción del mismo. Entre los agentes patógenos que dificultan el establecimiento y desarrollo del cultivo, se encuentran algunas especies del género Fusarium, consideradas de importancia económica por las pérdidas que generan. El objetivo de este trabajo fue identificar molecularmente las poblaciones de Fusarium presentes en maracuyá (Passiflora edulis). Entre enero y diciembre de 2015 se realizó el aislamiento de 35 muestras de diferentes órganos afectados de la planta y provenientes de localidades ubicadas en cinco municipios del Valle del Cauca, Colombia. Se seleccionaron y purificaron ocho aislamientos pertenecientes al género de interés para realizar la extracción de ADN y amplificación de la región TEF 1 alpha. Los productos de PCR fueron secuenciados y comparados con las bases de datos del NCBI y del Fusarium ID. Los aislamientos pertenecían a: Fusarium incarnatum, Fusarium proliferatum y Fusarium solani, la primera especie fue la de mayor ocurrencia en las muestras evaluadas. En el análisis de las relaciones filogenéticas realizado mediante el programa MEGA 6, se usó el coeficiente de similitud del vecino más cercano, lo que permitió observar variabilidad entre los aislamientos evaluados.es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.formattext/html
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dc.languagespa
dc.publisherUniversidad de Costa Ricaen-US
dc.relationhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/31462
dc.relationhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/31535
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dc.relationhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/35314
dc.relationhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/27114/35315
dc.sourceAgronomía Mesoamericana; 2018: Agronomía Mesoamericana: Vol. 29, Issue 1 (January-April); 53-61en-US
dc.sourceAgronomía Mesoamericana; 2018: Agronomía Mesoamericana: Vol. 29, Nº 1 (Enero-abril); 53-61es-ES
dc.sourceAgronomía Mesoamericana; 2018: Agronomía Mesoamericana: Vol. 29, Nº 1 (Enero-abril); 53-61pt-PT
dc.source2215-3608
dc.source1021-7444
dc.subjectfusariosisen-US
dc.subjectPassiflora edulisen-US
dc.subjectfungal diseasesen-US
dc.subjectgenetic variation.en-US
dc.subjectfusariosises-ES
dc.subjectPassiflora edulises-ES
dc.subjectenfermedades fungosases-ES
dc.subjectvariación genética.es-ES
dc.subjectFitopatologiaes-ES
dc.subjectBiotecnologiaes-ES
dc.subjectMicrobiologiaes-ES
dc.titleMolecular identification of Fusarium isolates associated with passion fruit in five locations from Valle del Cauca, Colombia.en-US
dc.titleIdentificación molecular de aislamientos de Fusarium asociados a maracuyá en el Valle del Cauca, Colombiaes-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typeArticleen-US
dc.typeExtracción de ADNes-ES


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