Genetic diversity of avocado (Persea americana Mill) cultivars in Antioquia, Colombia.

Diversidad genética de cultivares de aguacate (Persea americana Mill) en Antioquia, Colombia.

dc.creatorCañas-Gutiérrez, Gloria Patricia
dc.creatorGalindo-López, Leonardo F.
dc.creatorArango-Isaza, Rafael
dc.creatorSaldamando-Benjumea, Clara I.
dc.date2015-01-01
dc.date.accessioned2023-08-03T18:51:36Z
dc.date.available2023-08-03T18:51:36Z
dc.identifierhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/16936
dc.identifier10.15517/am.v26i1.16936
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/7903559
dc.descriptionThe aim of this work was to characterize 111 native avocado (Persea americana Mill) cultivars with molecular and morphological markers. This study was carried out from 2009 to 2011 at Antioquia Department, Colombia, South America. The molecular analysis was performed with 38 AFLP (amplified fragment length polymorphism) and the primers E-ACT/M-CTC and E-AAC/M-CAA, that produced high levels of expected hetorozygocities for avocado from the municipalities of Valparaíso, Santa Bárbara and La Ceja. The native cultivars obtained from these places showed 100% genetic similarity with Hass. Twenty three shared AFLP loci where observed among all native genetic material and Hass, Fuerte and Reed from Antioquia. A UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) dendrogram constructed with the AFLPs and Nei genetic distance produced three clusters that grouped individuals that are geographically close and in places climatically similar. In addition, a principal components analysis (PCA) based on morphological traits produced three groups that are coincident with the dendrogram. The AMOVA (Analysis of Molecular Variance) estimated a significant but low Phipt (Fst analogous) value, indicating genetic differentiation among the Antioquia avocados. The results obtained in this work identified zones of Antioquia with native material that could potentially be used as injertation for the Hass variety, as a first step towards certification of avocado vegetative material in Colombia.en-US
dc.descriptionEl objetivo del trabajo fue realizar la caracterización molecular y morfológica de 111 cultivares criollos y comerciales de aguacate (Persea americana Mill). El estudio se realizó entre los años 2009 y 2011 en el departamento de Antioquia, Colombia, Sur América. El análisis molecular se realizó con 38 AFLP (amplified fragment length polymorphism) obtenidos con los cebadores E-ACT/M-CTC y E-AAC/M-CAA, con los cuales se encontraron altos niveles de heterocigocidad esperada para los municipios de Valparaíso, Santa Bárbara y la Ceja. Los cultivares criollos de estas localidades compartieron un 100% de bandas con la variedad Hass. Se encontraron 23 loci de AFLP compartidos entre todos los cultivares criollos y las variedades Hass, Fuerte y Reed de Antioquia. Un dendrograma obtenido con los AFLP, el algoritmo UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) y la distancia genética de Nei, produjo tres agrupaciones genéticas que incluyeron individuos que se encontraban con gran cercanía geográfica y similares condiciones climáticas. Un análisis de componentes principales (ACP) basado en los caracteres morfológicos, produjo tres agrupaciones concordantes con lo encontrado en el dengrograma. El Análisis de Varianza Molecular (AMOVA) estimó un valor significativo pero bajo de PhiPT (análogo del Fst), por lo que existe diferenciación genética del aguacate en Antioquia. Los resultados obtenidos identificaron las zonas de Antioquia con cultivares criollos que pueden ser potencialmente utilizados como porta injertos para la variedad Hass, como primer paso para la certificación de material vegetal de aguacate en Colombia.es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.formattext/html
dc.languagespa
dc.publisherUniversidad de Costa Ricaen-US
dc.relationhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/16936/16561
dc.relationhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/16936/19317
dc.sourceAgronomía Mesoamericana; 2015: Agronomía Mesoamericana: Vol. 26, Issue 1 (January-June); 129-143en-US
dc.sourceAgronomía Mesoamericana; 2015: Agronomía Mesoamericana: Vol. 26, Nº 1 (Enero-junio); 129-143es-ES
dc.sourceAgronomía Mesoamericana; 2015: Agronomía Mesoamericana: Vol. 26, Nº 1 (Enero-junio); 129-143pt-PT
dc.source2215-3608
dc.source1021-7444
dc.subjectgenética de poblacioneses-ES
dc.subjectidentificación moleculares-ES
dc.subjectcaracterización morfológicaes-ES
dc.subjectpopulation geneticsen-US
dc.subjectmolecular identificationen-US
dc.subjectmorphological characterizationen-US
dc.titleGenetic diversity of avocado (Persea americana Mill) cultivars in Antioquia, Colombia.en-US
dc.titleDiversidad genética de cultivares de aguacate (Persea americana Mill) en Antioquia, Colombia.es-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typeArticleen-US


Este ítem pertenece a la siguiente institución