The STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europe

The STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europe

dc.creatorAzofeifa, Jorge
dc.creatorHahn, Meinhard
dc.creatorRuiz, Edward
dc.creatorHummerich, Lars
dc.creatorMorales, Ana I
dc.creatorJiménez, Gerardo
dc.creatorBarrantes, Ramiro
dc.date2004-09-01
dc.date.accessioned2023-08-03T17:51:12Z
dc.date.available2023-08-03T17:51:12Z
dc.identifierhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/15352
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/7897266
dc.descriptionThe STR (AAAAT)n within intron 1 of the TP53 locus was screened in 17 populations from 3 main ethnic groups: Europeans, Asiatics, and Africans, and from the hybrid population of Costa Rica (1968 samples). Three alleles, 126/7 (bp/copies of the repeat), 131/8 and 136/9 were the most prevalent in all populations. Other alleles rarely reached frequencies of 10% or higher. Observed heterozygosities ranged between 0.351 and 0.829. Patterns of diversity fit well with both the geographic origin of the samples and the history of the populations screened. A statistical test suggests that single-step mutational events have been the main mechanism producing new alleles at this locus. Fixation indexes (RST) for this marker showed an effect of population subdivision on divergence only within the Asiatic group; they were insensitive at the level of major ethnic groups as well as within Africans and within Europeans.en-US
dc.descriptionSe estudió el polimorfismo del microsatélite (AAAAT)n del intrón 1 del gene TP53 en 17 poblaciones de 3 grupos étnicos: europeos, asiáticos, y africanos subsaharianos, así como de la población híbrida de Costa Rica (en total 1968 muestras). Tres alelos, 126/7 (pares de bases/ copias de la repetición), 131/8 y 136/9 fueron los más frecuentes en todas las poblaciones, aunque se observaron otros alelos usualmente a frecuencias menores al 10%. Las heterocigosis observadas variaron de 0.351 a 0.829. La distribución de la diversidad parece concordar con el origen geográfico de las muestras y con la historia de las poblaciones estudiadas. Una prueba estadística indica que el evento mutacional que más alelos nuevos produce en este marcador es el de un solo paso (expansión o contracción de una sola copia de la repetición). El índice de fijación RST mostró los efectos de la subdivision de poblaciones sólo dentro del grupo de los asiáticos y mostró falta de sensibilidad cuando los grupos comparados eran de niveles superiores de clasificación (europeos, asiáticos, y africanos) o cuando la comparación se hizo entre los grupos más antiguos (africanos y europeos).es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.languageeng
dc.publisherUniversidad de Costa Ricaen-US
dc.relationhttps://revistas.ucr.ac.cr/index.php/rbt/article/view/15352/14670
dc.rightsDerechos de autor 2004 Revista de Biología Tropicales-ES
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0es-ES
dc.sourceRevista de Biología Tropical; Vol. 52 No. 3 (2004): Volume 52 - Regular number 3 - September 2004; 645–657en-US
dc.sourceRevista de Biología Tropical; Vol. 52 Núm. 3 (2004): Volumen 52 - Número regular 3 - Setiembre 2004; 645–657es-ES
dc.sourceRevista Biología Tropical; Vol. 52 N.º 3 (2004): Volumen 52 - Número regular 3 - Setiembre 2004; 645–657pt-PT
dc.source2215-2075
dc.source0034-7744
dc.source10.15517/rbt.v1i2
dc.subjectpopulation geneticsen-US
dc.subjectmicrosatellite polymorphismen-US
dc.subjecteuropeansen-US
dc.subjectasiaticsen-US
dc.subjectsub-saharan africansen-US
dc.subjectgenetica de poblacioneses-ES
dc.subjectmicrosateliteses-ES
dc.subjectpolimorfismoses-ES
dc.subjecteuropeoses-ES
dc.subjectasiaticoses-ES
dc.subjectafricanos del sub- saharaes-ES
dc.titleThe STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europeen-US
dc.titleThe STR polymorphism (AAAAT)n within the intron 1 of the tumor protein 53 (TP53) locus in 17 populations of different ethnic groups of Africa, America, Asia and Europees-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typeArticleen-US


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