Asociación de genoma completo para el hábito de crecimiento en trigo harinero (Triticum aestivum L.)

dc.creatorGómez-Espejo, A.L.
dc.creatorSansaloni, C.P.
dc.creatorBurgueño, J.
dc.creatorToledo, F.H.
dc.creatorReyes-Valdés, M.H.
dc.date2022-01-21T01:10:20Z
dc.date2022-01-21T01:10:20Z
dc.date2021
dc.date.accessioned2023-07-17T20:08:39Z
dc.date.available2023-07-17T20:08:39Z
dc.identifierhttps://hdl.handle.net/10883/21875
dc.identifier10.19136/era.a8n2.2912
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/7513643
dc.descriptionEl hábito de crecimiento de los trigos harineros (primavera e invierno) está determinado primordialmente por el proceso de vernalización, regulado por los genes Vrn. Algunos estudios sugieren la implicación de otros genes en la diferenciación de dicha característica. Por ello, se tiene por objetivo la identificación genómica de regiones con una posible relación funcional al hábito de crecimiento. Se realizó un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) con dos enfoques de análisis: a) FarmCPU (Unificación de Probabilidad Circulante de Modelo fijo y aleatorio) y b) BLINK (Información Bayesiana y Desequilibrio de ligamiento Anidado Iterativamente) implementados en el paquete GAPIT de R. Se utilizaron datos de 25 681 loci de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP’s) de 7 757 colectas de T. aestivum del banco de germoplasma del CIMMYT clasificadas en cuanto a su hábito de crecimiento. Se identificaron 593 marcadores SNP’s con una alta asociación al hábito de crecimiento (p < 0.01). Pero solo 70 marcadores formaban bloques de asociación (BA) en 11 cromosomas. Como se esperaba, se identificó un BA cercano al gen Vrn1 en el cromosoma 5A. Adicionalmente se identificaron 20 regiones genómicas (BA) con asociación al hábito de crecimiento, en las que se detectó la presencia de proteínas de respuesta al estrés implicadas en procesos de aclimatación y des-aclimatación. Los resultados sugieren la participación de nuevos genes en la determinación del hábito de crecimiento en Triticum aestivum y su potencial predictivo en colectas no clasificadas.
dc.languageEnglish
dc.publisherUniversidad Juárez Autónoma de Tabasco
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dc.rightsOpen Access
dc.source2
dc.source8
dc.source2912
dc.source2007-901X
dc.sourceEcosistemas y Recursos Agropecuarios
dc.subjectAGRICULTURAL SCIENCES AND BIOTECHNOLOGY
dc.subjectGenome-Wide Association Study
dc.subjectGrowth Habits
dc.subjectBread Wheat
dc.subjectSTRESS
dc.subjectGENOMES
dc.subjectPLANT HABIT
dc.subjectSINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM
dc.subjectSOFT WHEAT
dc.titleAsociación de genoma completo para el hábito de crecimiento en trigo harinero (Triticum aestivum L.)
dc.typeArticle
dc.typePublished Version
dc.coverageMexico


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