O objetivo deste trabalho é analisar implicações da terceirização para organizações universitárias federais na gestão de seus hospitais universitários, na perspectiva dos órgãos de controle externo. Os procedimentos metodológicos escolhidos para realizá-los estão baseados na pesquisa qualitativa, descritiva, bibliográfica e documental. Os resultados mostram que o quantitativo de terceirizados contratados pelos hospitais universitários nos últimos anos fez com que o TCU passasse a acompanhar de perto tal fenômeno. A atuação do TCU evidenciou os motivos que levaram as citadas unidades hospitalares a optar pela terceirização, bem como as inconformidades legais referentes a tais ações, e as medidas saneadoras que deveriam ser adotadas por elas para lidar com a problemática.