Este artigo refere-se ao processo de Autoavaliação Institucional realizado em um dos Institutos Federais de Educação Profissional e Tecnológica do Brasil, o Instituto Federal Fluminense. O processo é baseado nos princípios do INEP (Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira), mas é considerado inovador na sua forma de concepção, pois utiliza de conceitos e práticas relacionados a modelagem de processo e gerência de projetos. A modelagem dos processos da Autoavaliação Institucional ocorreu através do desenho das suas etapas e a estruturação de cada autoavaliação ocorreu na forma de projeto. Para este artigo foi utilizada a autoavaliação dos cursos ofertados regularmente pelo instituto. Como resultado deste trabalho propõe-se a melhoria dos processos organizacionais do instituto baseada nas análises dos indicadores relacionados a infraestrutura, serviços e cursos obtidos através da autoavaliação.