Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos.Foram coletadas 42 amostras de erva-mate adquiridas em estabelecimentos comerciais no período de novembro/2003 a janeiro/2004 nas regiões Oeste, Serrana, Norte e Sul de Santa Catarina nas quais foi analisada a microbiota fúngica, a presença de espécies produtoras de micotoxinas e a presença de aflatoxinas, ocratoxinas e fumonisinas. Quanto à contagem total de fungos e leveduras 28,57 % das marcas de erva-mate analisadas apresentaram valores superiores a 103 UFC/g, acima do limite estabelecido pela legislação brasileira. Os seguintes gêneros fúngicos foram isolados em ágar extrato de malte, em ordem decrescente de freqüência Aspergillus spp., Mucor spp.,Rhizopus spp., Penicillium spp., Paecilomyces spp., Helminthosporium spp., Botrytisspp., Fusarium spp. e fungos não-esporulados. Das cepas de Aspergillius spp. 1,28 % foram produtoras de aflatoxinas do grupo B e 0,11 % de ocratoxina A. A produção de ocratoxina A foi verificada em 50 % das cepas de Penicillium spp. isoladas. A cepa de Fusarium não apresentou potencial toxigênico para a produção de fumonisinas. Nenhuma das micotoxinas analisadas foi detectada nas amostras de erva-mate.