Quantitative and qualitative analysis of the rhizospheric and endophytic colonization of native bacteria isolated from Solanum hindsianum in different Solanaceae of agricultural interest

dc.contributorEDGARDO ALFREDO SEPULVEDA SANCHEZ HIDALGO
dc.creatorJenny Jocabet Meza Contreras
dc.date2022
dc.date.accessioned2023-03-16T14:35:17Z
dc.date.available2023-03-16T14:35:17Z
dc.identifierhttp://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3812
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/6231756
dc.descriptionLas plantas se relacionan estrechamente con la microbiota del suelo. Algunas bacterias tienen efectos benéficos sobre el crecimiento vegetal. Estas bacterias se conocen como bacterias promotoras de crecimiento vegetal, o PGPB por sus siglas en inglés, y se utilizan en la agricultura como una alternativa sustentable al uso de agroquímicos. Sin embargo, su efectividad depende de su adaptación a las condiciones ambientales, por lo que se ha propuesto utilizar cepas nativas de la región, aisladas de plantas cercanas filogenéticamente al cultivo de interés. Previamente, en nuestro grupo se aislaron e identificaron bacterias rizosféricas y endófitas de la solanácea nativa Solanum hindsianum capaces de promover el crecimiento vegetal. De las bacterias identificadas se seleccionaron cuatro cepas, EBCAb1, EBCAe10, rbES061 y rbES087, todas pertenecientes al género Pseudomonas. En este trabajo se marcaron las cepas con un transposón Tn7, mediante electroporación y conjugación, este transposón confiere resistencia a un antibiótico y un fluoróforo. Se utilizaron cuatro fluoróforos para marcar las cepas teniendo un total de 11 cepas marcadas. Se seleccionaron las cepas EBCAe10 y rbES061, ambas marcadas con el transposón Tn7-152, para evaluar la colonización rizosférica, epífita y endófita y la promoción de crecimiento, en dos condiciones de riego, en plantas de chile, tomate y tomatillo en cámara de crecimiento e invernadero. En cámara de crecimiento ambas cepas lograron colonizar de manera rizosférica y epífita las plantas de tomate, chile y tomatillo pero la cepa EBCAe10 fue la única con la capacidad de colonizar de manera endófita. En invernadero la cepa EBCAe10 colonizó rizosféricamente el cultivo de chile y tomate en condiciones de riego bajo, y en riego alto, la cepa rbES061 colonizó chile y tomate en riego alto y tomate en riego bajo. La cepa EBCAe10 colonizó de manera endófita y epífita en ambos cultivos y condiciones de riego en invernadero. Este trabajo provee información acerca de la colonización de dos cepas nativas de Baja California, siendo la cepa EBCAe10 la que obtuvo mejores niveles de colonización.
dc.descriptionPlants interact closely with the soil microbiota. Some bacteria have beneficial effects on plant growth. These bacteria are known as growth-promoting bacteria, or PGPB, and are used in agriculture as an alternative to agrochemicals. However, its effectiveness depends on its adaptation to environmental conditions, due to it has been proposed to use native strains. Previously, our group isolated and identified rhizospheric and endophytic bacteria from the native nightshade Solanum hindsianum, characterized as PGPB. From them, four strains were selected, EBCAb1, EBCAe10, rbES061 and rbES087, all belonging to the Pseudomonas genus, which were promising in plant growth promotion assays. In this work, the strains were labeled with a Tn7 transposon by electroporation and conjugation, this transposon conferred resistance to an antibiotic and a fluorophore. Four fluorophores were used to label the strains, making a total of 11 labeled strains. Strains EBCAe10 and rbES061, both marked with the Tn7-152 transposon, were selected to evaluate their rhizospheric, epiphytic and endophytic colonization, and plant growth promotion, under two irrigation conditions in pepper, tomato and tomatillo plants in growth chambers and in greenhouse conditions. Strain EBCAe10 was the only one that colonized the endosphere of all plant species in greenhouse and growth chamber conditions; rbES061 had a rhizospheric and epiphytic colonization in growth chamber conditions. This work provides information about the colonization of two native Baja Californian strains, EBCAe10 being the one with the best colonization levels.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCICESE
dc.relationcitation:Meza Contreras, J.J. 2022. Análisis cuantitativo y cualitativo de la colonización rizosférica y endófita de bacterias nativas aisladas de Solanum hindsianum en distintas solanáceas de interés agrícola. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 66 pp.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/Autor/PGPB, Solanaceae, colonización, zonas áridas
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/Autor/PGPR, Solanaceae, Colonization Arid zones
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/24
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2414
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241403
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/241403
dc.titleAnálisis cuantitativo y cualitativo de la colonización rizosférica y endófita de bacterias nativas aisladas de Solanum hindsianum en distintas solanáceas de interés agrícola
dc.titleQuantitative and qualitative analysis of the rhizospheric and endophytic colonization of native bacteria isolated from Solanum hindsianum in different Solanaceae of agricultural interest
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis


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