dc.contributor | CNPq | pt-BR |
dc.creator | Bruna Araujo Pinheiro; Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, Paraná, Brasil | |
dc.creator | César Manuel Vargas Benítez; Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, Paraná, Brasil | |
dc.creator | Leandro Takeshi Hattori; Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, Paraná, Brasil | |
dc.creator | Lucas Destefani Fabri; Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Curitiba, Paraná, Brasil | |
dc.date | 2020-05-21 00:43:18 | |
dc.date.accessioned | 2022-12-07T17:52:52Z | |
dc.date.available | 2022-12-07T17:52:52Z | |
dc.identifier | https://eventos.utfpr.edu.br//sicite/sicite2019/paper/view/4149 | |
dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/5306059 | |
dc.description | Para as proteínas estarem em sua configuração funcional, suas estruturas precisam passar por um processo denominado dobramento proteico. No qual, independentemente de sua conformação inicial, atinge em uma estrutura final similar, a estrutura nativa. A má formação das estruturas pode causar doenças degenerativas como Alzheimer e alguns tipos de câncer. Na literatura existem diversos trabalhos que exploram a predição da estrutura nativa a partir das informações das sequências dos aminoácidos. Entretanto, as pesquisas sobre o caminho ou trajetória de dobramento ainda são escassos. Assim, este trabalho propõe a criação de conjunto de dados de trajetórias de dobramento de proteínas utilizando o método de Dinâmica Molecular (DM), a fim de auxiliar futuros estudos sobre este processo. Também foi proposta a paralelização do DM utilizando a arquitetura Graphics Processing Unit (GPU). Neste estudo foram selecionadas quatro proteínas globulares, 13FIBO, 2GB1, 1PLC e 5NAZ, com 13, 56, 99 e 229 aminoácidos respectivamente, sendo que a posição espaço-temporal de cada aminoácido, a energia potencial e os raios de giração foram armazenados. Os dados das trajetórias produzidos por DM indicaram ser coerentes com os paradigmas de convergência, formando configurações estruturais similares ao final das simulações. | pt-BR |
dc.format | application/pdf | |
dc.language | pt | |
dc.publisher | Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica da UTFPR | pt-BR |
dc.rights | Autores que submetem a esta conferência concordam com os seguintes termos:<br /> <strong>a)</strong> Autores mantém os direitos autorais sobre o trabalho, permitindo à conferência colocá-lo sob uma licença <a href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">Licença Creative Commons-Attribution</a>, que permite livremente a outros acessar, usar e compartilhar o trabalho com o crédito de autoria e apresentação inicial nesta conferência.<br /> <strong>b)</strong> Autores podem abrir mão dos termos da licença CC e definir contratos adicionais para a distribuição não-exclusiva e subsequente publicação deste trabalho (ex.: publicar uma versão atualizada em um periódico, disponibilizar em repositório institucional, ou publicá-lo em livro), com o crédito de autoria e apresentação inicial nesta conferência.<br /> <strong>c)</strong> Além disso, autores são incentivados a publicar e compartilhar seus trabalhos online (ex.: em repositório institucional ou em sua página pessoal) a qualquer momento antes e depois da conferência. | |
dc.source | Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica da UTFPR; XXIV Seminário de Iniciação Científica e Tecnológica da UTFPR | 0 |
dc.subject | Ciências Biológicas; Ciência da Computação; Engenharias; | pt-BR |
dc.subject | Dinâmica molecular. Paralelismo. Dobramento de proteínas. | pt-BR |
dc.title | Estudo do caminho de dobramento de proteínas globulares usando dinâmica molecular com modelo granuloso | 0 |
dc.type | Documento avaliado pelos pares | pt-BR |