Respiratory pathogens in infants less than two months old hospitalized with acute respiratory infection

Abstract

Las infecciones respiratorias agudas (IRA) son una causa habitual de morbimortalidad en infantes y los virus respiratorios son los agentes causales más frecuentes. El objetivo de este trabajo fue determinar la frecuencia de patógenos respiratorios, sus características y la evolución clínica de infantes menores de dos meses internados por IRA. Se realizó un estudio retrospectivo que comprendió 5 anos ˜ (2008-2011, 2014-2016). Se estudiaron los virus respiratorios y las bacterias atípicas utilizando el panel respiratorio FilmArray. Se evaluaron las características demográficas y clínicas, así como la evolución durante la internación. En 137 infantes menores de dos meses internados por IRA se determinó una positividad del 94,9% en 117 lactantes con infección adquirida en la comunidad (IRA-C) y del 20,0% en 20 lactantes que adquirieron la infección durante su hospitalización en la unidad de cuidados intensivos neonatal (IRA-N) (p < 0,001). En los infantes con IRA-C los virus más frecuentes fueron sincicial respiratorio (RSV) (52,1%) y rinovirus/enterovirus (RV/EV) (41,0%). Se determinaron coinfecciones en un cuarto de los infantes, la combinación RSV-RV/EV fue la más frecuente. En los infantes con IRA-N se detectó RV/EV, RSV o parainfluenza-3 como únicos patógenos. La mayoría de los infantes con IRA-C presentaron IRA baja (81,2%), mientras que más de la mitad de los infantes en UCIN tenían IRA alta (55,0%). La mediana de la duración de la internación en infantes con IRA-C fue de 4 días (RIC: 2-6). Los infantes positivos con IRA-N tuvieron una mediana de internación más larga (71 días [RIC: 42-99]) en comparación con los infantes negativos (58 días [RIC: 49-71]) (p = 0,507). Los virus respiratorios fueron los principales agentes causales de IRA adquirida en la comunidad en infantes menores de dos meses que requirieron internación; los virus más frecuentes fueron RSV y RV/EV. Aunque se observó una baja tasa de positividad de patógenos en infantes con infección nosocomial, estos agentes podrían prolongar la duración de la internación.

Lower acute respiratory infections (ARI) are a frequent cause of morbidity and mortality in infants, respiratory viruses being the major causative agents. The aim of this work was to determine the respiratory pathogen frequency, the clinical characteristics and the outcome in infants <2 months old hospitalized with ARI. A retrospective study was performed during a five-year period (2008–2011, 2014–2016). Respiratory viruses and atypical bacteria were studied using the FilmArray-Respiratory Panel. Demographic and clinical characteristics, hospitalization course and outcomes were evaluated. Of the 137 infants <2 months old hospitalized with ARI studied, a 94.9% positivity rate as determined in 117 infants with community-acquired infection and 20.0% in 20 infants who acquired the infection during their birth hospitalization in the neonatal intensive care units (NICU) (nosocomial ARI) (p < 0.001). In infants with community-acquired infection, Respiratory syncytial virus (RSV) (52.1%) and Rhinovirus/Enterovirus (RV/EV) (41.0%) were the most frequent detected pathogens. Coinfections were determined in one quarter of the infants, RSV-RV/EV being the most frequent combination. In infants with nosocomial infection, RV/EV, RSV or Parainfluenza-3 were detected as single pathogens. Most infants with community-acquired infection presented lower ARI (81.2%) while most infants in the NICU had upper ARI (55.0%). The median length of stay (LOS) in infants with community-acquired ARI was 4 days (IQR: 2–6). Positive infants with nosocomial infection had longer median LOS (71 days [IQR:42–99]) compared to negative infants (58 days [IQR: 49–71]) (p = 0.507). Respiratory viruses were detected as the major causative agents of community-acquired infection in hospitalized infants <2-months old, RSV and RV/EV being the most frequently detected. Although a low pathogen positivity rate was observed in infants with nosocomial infection, they may prolong the LOS.