Plasmidic resistance to colistin mediated by mcr-1 gene in Escherichia coli clinical isolates in Argentina: A retrospective study, 2012-2018
Resistencia plasmídica a colistina mediada por el gen mcr-1 en aislamientos clínicos de Escherichia coli de Argentina: Un estudio retrospectivo, 2012-2018;
Resistência à colistina em plasmídeos mediada pelo gene mcr-1 em isolados clínicos de Escherichia coli da Argentina: Um estudo retrospectivo, 2012-2018
dc.creator | Faccone, Diego Francisco | |
dc.creator | Rapoport, Mario Daniel | |
dc.creator | Albornoz, Ezequiel Pablo | |
dc.creator | Celaya, Federico | |
dc.creator | de Mendieta, Juan Manuel | |
dc.creator | de Belder, Denise Gisele | |
dc.creator | Lucero, María Celeste | |
dc.creator | Gómez, Sonia Alejandra | |
dc.creator | Danze, Diego | |
dc.creator | Pasteran, Fernando | |
dc.creator | Corso, Alejandra | |
dc.date.accessioned | 2022-09-27T13:47:26Z | |
dc.date.accessioned | 2022-10-15T00:30:40Z | |
dc.date.available | 2022-09-27T13:47:26Z | |
dc.date.available | 2022-10-15T00:30:40Z | |
dc.date.created | 2022-09-27T13:47:26Z | |
dc.date.issued | 2020-09 | |
dc.identifier | Faccone, Diego Francisco; Rapoport, Mario Daniel; Albornoz, Ezequiel Pablo; Celaya, Federico; de Mendieta, Juan Manuel; et al.; Plasmidic resistance to colistin mediated by mcr-1 gene in Escherichia coli clinical isolates in Argentina: A retrospective study, 2012-2018; Pan American Health Organization; Revista Panamericana de Salud Pública; 44; 1; 9-2020; 1-8 | |
dc.identifier | 1020-4989 | |
dc.identifier | http://hdl.handle.net/11336/170616 | |
dc.identifier | 1680-5348 | |
dc.identifier | CONICET Digital | |
dc.identifier | CONICET | |
dc.identifier.uri | https://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/4325022 | |
dc.description.abstract | Objective. To describe the resistance profile and the genetic characteristics of Escherichia coli isolates that harbor the mobilizable colistin resistance gene mcr-1 in Argentina. Methods. This was a retrospective study of 192 E. coli isolates positive for mcr-1 obtained from 69 hospitals of Buenos Aires City and 14 Argentinean provinces in 2012 - 2018. The antimicrobial susceptibility was performed by agar diffusion, broth macrodilution, and/or agar dilution. Standard polymerase chain reaction (PCR) was performed to detect resistance genes and incompatibility groups; specific PCR was applied to discriminate between blaCTX-M allelic groups and mcr-1.5 variant. The genetic relatedness among isolates was evaluated by XbaI-pulsed field gel electrophoresis and multilocus sequence typing in a subset of isolates. Results. All E. coli isolates showed minimal inhibitory concentrations to colistin ≥ 4μg/mL; nearly 50% were resistant to third-generation cephalosporins, with CTX-M-2 being the main extended-spectrum β-lactamase detected. Five E. coli were carbapenemase-producers (3 NDM, 2 KPC). The mcr-1.5 variant was detected in 13.5% of the isolates. No genetic relationship was observed among the mcr-1-positive E. coli clinical isolates, but a high proportion (164/192; 85.4%) of IncI2 plasmids was detected. Conclusions. The presence of IncI2 plasmids among highly diverse E. coli clones suggests that the mcr-1 gene's wide distribution in Argentina may be driven by the horizontal transmission of IncI2 plasmids. | |
dc.description.abstract | Objetivo. Describir el perfil de resistencia y las características genéticas de aislamientos clínicos de Escherichia coli que portan el gen movilizable de resistencia a colistina mcr-1 en Argentina. Métodos. Se realizó un estudio retrospectivo para analizar 192 aislamientos de E. coli mcr-1 positivo, obtenidos en 69 hospitales de la Ciudad de Buenos Aires y 14 provincias de Argentina entre 2012 y 2018. La sensibilidad a los antimicrobianos se analizó mediante los métodos de difusión en agar, macrodilución en caldo y/o dilución en agar. Se aplicó la técnica estándar de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para detectar genes de resistencia y grupos de incompatibilidad; se aplicó PCR específica para distinguir entre variantes alélicas del gen blaCTX-M y la variante mcr-1.5. La relación genética entre los aislamientos fue evaluada mediante la técnica de electroforesis en gel de campo pulsado usando la enzima Xbal y la tipificación por secuencias de múltiples locus en un subconjunto de aislamientos. Resultados. Todos los aislamientos de E. coli mostraron concentraciones inhibitorias mínimas de colistina ≥ 4μg/mL. Casi el 50% mostró resistencia a las cefalosporinas de tercera generación y CTX-M-2 fue la β-lactamasa de espectro extendido que más se detectó. Cinco aislamientos de E. coli mostraron ser productoras de carbapenemasas (3 NDM, 2 KPC). La variante mcr-1.5 se detectó en 13,5% de las cepas aisladas. No se observó relación genética entre los aislamientos clínicos estudiados de E. coli positivas para mcr-1, aunque sí se detectó una proporción elevada (164/192; 85,4%) de plásmidos Incl2. Conclusiones. La elevada ocurrencia de plásmidos IncI2 en un grupo altamente diverso de clones de E. coli podría indicar que la amplia difusión del gen mcr-1 en Argentina estaría asociada a la transmisión horizontal de plásmidos IncI2. | |
dc.description.abstract | Objetivo. Descrever o perfil de resistência e as características genéticas de isolados clínicos de Escherichia coli que carregam o gene mobilizábel de resistência à colistina mcr-1 na Argentina. Métodos. Neste estudo retrospectivo, foram analizados 192 isolados de E. coli positivos para mcr-1 obtidos em 69 hospitais da Cidade de Buenos Aires e 14 províncias da Argentina, entre 2012 e 2018. A sensibilidade aos antimicrobianos foi examinada usando métodos de difusão em ágar, macrodiluição em caldo e/ou diluição em ágar. A técnica padrão de reação em cadeia da polimerase (PCR) foi aplicada para detectar genes de resistência e grupos de incompatibilidade; a PCR específica foi aplicada para discriminar entre variantes alélicas do gene blaCTX-M e a variante mcr-1.5. A relação genética entre os isolados foi avaliada por eletroforese em gel de campo pulsado usando a enzima XbaI e a tipagem por sequências de múltiplos lócus, em um subconjunto de isolados. Resultados. Todos os isolados de E. coli apresentaram concentrações inibitórias mínimas de colistina ≥4μg/ mL. Quase 50% foram resistentes às cefalosporinas de terceira geração, e CTX-M-2 foi a β-lactamase de espectro estendido mais detectada. Cinco isolados de E. coli foram produtores de carbapenemase (3 NDM, 2 KPC). A variante mcr-1.5 foi detectada em 13,5% dos isolados. Não foi observada relação genética entre os isolados clínicos de E. coli positivos para mcr-1, mas foi detectada uma alta proporção (164/192; 85,4%) de plasmídeos IncI2. Conclusões. A alta ocorrência de plasmídeos IncI2 em um grupo altamente diverso de clones de E. coli sugere que a ampla distribuição do gene mcr-1 na Argentina estaria associada a transmissão horizontal de plasmídeos IncI2. | |
dc.language | eng | |
dc.publisher | Pan American Health Organization | |
dc.relation | info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://iris.paho.org/handle/10665.2/52324 | |
dc.relation | info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.26633/RPSP.2020.55 | |
dc.rights | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
dc.subject | ARGENTINA | |
dc.subject | RESISTENCIA A MÚLTIPLES MEDICAMENTOS | |
dc.subject | ENTEROBACTERIACEAE | |
dc.subject | ESCHERICHIA COLI | |
dc.subject | COLISTINA | |
dc.title | Plasmidic resistance to colistin mediated by mcr-1 gene in Escherichia coli clinical isolates in Argentina: A retrospective study, 2012-2018 | |
dc.title | Resistencia plasmídica a colistina mediada por el gen mcr-1 en aislamientos clínicos de Escherichia coli de Argentina: Un estudio retrospectivo, 2012-2018 | |
dc.title | Resistência à colistina em plasmídeos mediada pelo gene mcr-1 em isolados clínicos de Escherichia coli da Argentina: Um estudo retrospectivo, 2012-2018 | |
dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
dc.type | info:ar-repo/semantics/artículo | |
dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion |