Genomic annotation and compartive analysis between Staphylococcus aureus bacteriophages

dc.contributorSuárez, Cristian A.
dc.creatorCarrasco, Soledad Telma
dc.date2020-10-04T21:12:20Z
dc.date2020-10-04T21:12:20Z
dc.date2018
dc.date2020-10-04T21:12:20Z
dc.date2020-10-04T21:12:20Z
dc.date2018
dc.date.accessioned2022-10-14T19:58:44Z
dc.date.available2022-10-14T19:58:44Z
dc.identifier1932-6203
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/2133/19059
dc.identifierhttp://hdl.handle.net/2133/19059
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/4292673
dc.descriptionStaphylococcus aureus es un patógeno bacteriano capaz de causar una amplia variedad de enfermedades tanto en humanos como en animales. Con el fin de entender la mecánica de su patogenia y de buscar tratamientos alternativos es que se recurre al uso de bacteriófagos. Los mismos son virus que infectan bacterias de manera altamente específica y tienen la capacidad de destruirlas. En este trabajo se realizó la anotación y el análisis comparativo de cuatro bacteriófagos provenientes de diferentes orígenes capaces de infectar S. aureus, dos de ellos líticos y dos temperados. Centrándose en sus diferencias se propuso la utilización de diferentes herramientas bioinformáticas y el análisis de diferentes genes para su estudio. Se logró caracterizar a los bacteriófagos y analizar tanto las diferencias como las similitudes genéticas con los pertenecientes a su misma familia. Se analizaron las endolisinas codificadas por estos fagos, de manera interesante un fago (vB_SauS_308) solo contiene el dominio CHAP de ésta. Por último, se realizó la búsqueda de genes que codifiquen factores de virulencia y toxinas.
dc.descriptionStaphylococcus aureus is a bacterial pathogen capable of causing a variety of diseases both in humans and in animals. We resort to the use of bacteriophages in order to understand the pathogenesis and look for alternative treatments. Phages are viruses that infect bacteria in a specific way and have the ability to lyse them. In this study the annotation and the comparative analysis of four bacteriophages from environmental, animal and human origin capable of infect S. aureus was carried out. Considering the differences between the phages the utilization of different bioinformatics tools and the selection of distinct genes has been proposed. It has been possible to describe the distinctive features and the similarities with those belonging to the same family. Endolysins were analysed, and one phage (vB_SauS_308) only shows CHAP domain. To finalize the search for genes encoding virulence factors and toxins was carried out.
dc.descriptionCarrasco, S. T. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherFCA-UNR
dc.relationParte de esta investigación aparece en el artículo: “Broad-range lytic bacteriophages that kill Staphylococcus aureus local field strains” publicado el 25 de Julio de 2017 en la revista PLoS ONE 12(7): e0181671. Su autoría le pertenece a Virginia Abatángelo, Natalia Peressutti Bacci, Carina A. Boncompain, Ariel A. Amadio, Soledad Carrasco, Cristian A. Suárez y Héctor R. Morbidoni.
dc.relationhttps://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0181671
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.rightsSoledad Telma Carrasco
dc.rightsopenAccess
dc.subjectStaphylococcus aureus
dc.subjectEnfermedades
dc.subjectOrganismos patógenos
dc.subjectEndolisinas
dc.subjectBacteriófagos
dc.subjectFago
dc.titleAnotación genómica y análisis comparativo entre bacteriófagos de Staphylococcus aureus
dc.titleGenomic annotation and compartive analysis between Staphylococcus aureus bacteriophages
dc.typemasterThesis
dc.typeTésis de Maestría
dc.typeacceptedVersion


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