Estudio in silico de L-asparaginasas de Streptomyces para la identificación de potenciales candidatas para el tratamiento de la Leucemia Linfocítica Aguda

Bioinformatic study of L-asparaginases from Streptomyces to identify potential candidates for the treatment of Acute Lymphoblastic Leukemia

dc.contributorALEJANDRO HUERTA SAQUERO
dc.creatorIVAN GONZALEZ TORRES
dc.date2018
dc.date.accessioned2022-10-12T20:17:09Z
dc.date.available2022-10-12T20:17:09Z
dc.identifierhttp://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2518
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/4130884
dc.descriptionLa L-asparaginasa tipo II de Escherichia coli es una enzima esencial en el tratamiento de la leucemia linfoblástica aguda. Tras su administración, el nivel de L-asparagina en el torrente sanguíneo se reduce y conduce a la apoptosis de los linfoblastos leucémicos debido a que son incapaces de sintetizar el aminoácido. Sin embargo, la alta inmunogenicidad de la enzima es la principal limitante para su uso y, aunada a su actividad L-glutaminasa, disminuye la eficacia del tratamiento. En este trabajo se identificaron, seleccionaron y caracterizaron L-asparaginasas de microorganismos del género Streptomyces con base en análisis bioinformáticos de su secuencia de aminoácidos, su perfil inmunogénico, modelado por homología y su afinidad por la L-asparagina. Finalmente, se propuso un modelo estructural y dos posibles sitios activos para una L-asparaginasa de Streptomyces scabrisporus, no caracterizada y que forma parte de una familia de proteínas poco estudiada. La baja inmunogenicidad y buena afinidad por la asparagina de la L-asparaginasa de Streptomyces scabrisporus predicha, permite proponerla como alternativa para el tratamiento de la leucemia linfocítica aguda.
dc.descriptionThe enzyme L-asparaginase from Escherichia coli is a therapeutic enzyme that has been a cornerstone in the clinical treatment of acute lymphoblastic leukemia for the last decades. However, treatment effectiveness is limited by the highly immunogenic nature of the protein and its dual-substrate activity towards L-glutamine. In this work, a bioinformatic approach was used to identify, select and characterize L-asparaginases from Streptomyces through sequence-based screening analyses, immunoinformatics, homology modeling and molecular docking studies. Furthermore, two putative binding sites and a 3D model were proposed for a previously uncharacterized L-asparaginase from Streptomyces scabrisporus. The predicted low immunogenicity and good affinity for asparagine of L-asparaginase from Streptomyces scabrisporus allows us to propose it as an alternative for the treatment of acute lymphocytic leukemia.
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherCICESE
dc.relationcitation:González Torres, I. 2018. Estudio in silico de L-asparaginasas de Streptomyces para la identificación de potenciales candidatas para el tratamiento de la Leucemia Linfocítica Aguda. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 60 pp.
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/Autor/L-asparaginasa, Streptomyces, inmunogenicidad
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/Autor/L-asparaginase, Immunogenicity, Streptomyces
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/24
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/2403
dc.subjectinfo:eu-repo/classification/cti/230216
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dc.titleEstudio in silico de L-asparaginasas de Streptomyces para la identificación de potenciales candidatas para el tratamiento de la Leucemia Linfocítica Aguda
dc.titleBioinformatic study of L-asparaginases from Streptomyces to identify potential candidates for the treatment of Acute Lymphoblastic Leukemia
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/masterThesis


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