MARCADORES MOLECULARES PARA CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA E GENÔMICA EM ESPÉCIES DE Psidium

Abstract

Marcador molecular pode ser um caracter visível ou um fenótipo molecular proveniente de um segmento específico de DNA, que pode ser expresso ou não. Os marcadores de DNA microssatélites e SNPs são os mais utilizados atualmente, possibilitam diferentes estudos de espécies vegetais por apresentarem vantagens como polimorfismo, abundância e robustez. Muitos desses são conservados, podendo ser estudados em espécies afins àquela para o qual foi desenvolvido. Esses marcadores são importantes no estudo de grupos pouco conhecidos, como as espécies do gênero Psidium L., as quais possuem importante papel ecológico e são de grande interesse econômico, entre as quais está a goiabeira (Psidium guajava). Neste trabalho objetivou-se desenvolver dois painéis de marcadores moleculares, um de SSR e outro de SNPs, que sejam polimórficos e estejam presentes em regiões conservadas para espécies de Psidium. Um painel multiplex, para caracterização interespecífica de 26 espécies do gênero, foi montado por marcadores microssatélites conservados e polimórficos. Os 15 SSR selecionados foram marcados com fluoróforos, testados em combinações e genotipados através de eletroforese capilar, enquanto os marcadores SNPs foram sequenciados por meio do método DArTseq. Para ambos marcadores foram feitas análises descritivas e agrupamentos, sendo um heatmap e agrupamento para os microssatélites e uma análise de coordenadas principais (PCoA) para os SNPs. Os marcadores microssatélites e SNPs selecionados apresentaram índices de diversidade úteis para estudos em P. guajava. Foi estabelecido um painel multiplex contendo sete marcadores microssatélites para genotipagem eficiente em genótipos de goiabeiras. Um total de 5.951 SNPs polimórficos em sequências conservadas foram selecionados para compor o painel em chip para espécies de Psidium. No geral, as duas metodologias foram eficientes e ambos os marcadores informativos e úteis para estudos intra e interespecíficos.